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Enregistrement W2085410738 · doi:10.1111/j.1399-0004.2002.tb02255.x

Cryptic chromosome rearrangements detected by subtelomere assay in patients with mental retardation and dysmorphic features

2002· article· en· W2085410738 sur OpenAlexaff
AJ Dawson, Sydney Putnam, Jack C. Schultz, D. Riordan, C. Prasad, C. R. Greenberg, BN Chodirker, AA Mhanni, AE Chudley

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensUniversity of ManitobaHealth Sciences CentreManitoba Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubtelomereKaryotypeBiologyGeneticsChromosomeCytogeneticsFluorescence in situ hybridizationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The regions near telomeres of human chromosomes are gene rich. Chromosome subtelomere rearrangements occur with a frequency of 7-10% in children with mild-to-moderate mental retardation (MR) and approximately 50% of cases are familial. Clinical investigation of subtelomere rearrangements is now prompted by fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis using specific DNA probes from all relevant chromosome ends. In our study, 40 children were selected for subtelomere assay using either the Chromophore Multiprobe-T Cytocell device or the VYSIS TelVision probes. Inclusion criteria were: developmental delay or MR; a normal 550 G-band karyotype; FRAXA negative; and at least one other clinical criterion. Exclusion criteria included an identified genetic or environmental diagnosis. Of the 40 patients analysed, four (10%) were found to have subtelomere rearrangements. Three of 40 (7.5%) were found to have an unbalanced subtelomere rearrangement and one of 40 (2.5%) was found to have an apparently normal variant subtelomere deletion. The first of the three with an unbalanced karyotype was the result of a familial translocation, the second was a de novo finding, and the origin of the third could not be determined. The subtelomere FISH assay detected almost twice the frequency of unbalanced karyotypes as those detected by 550 G-banding in our cytogenetics laboratory (4.7%). In addition, subtelomere screening was eight times more likely than fragile X screening in our DNA laboratory (1%) to detect genetic abnormalities in mentally handicapped individuals. Our findings support the view that screening for subtelomere rearrangements has a greater positive yield than other commonly used genetic investigations and, if cost and resources permit, should be the next diagnostic test of choice in a child with unexplained MR/dysmorphisms and a normal 550 G-band karyotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,708

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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