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Enregistrement W2085458745 · doi:10.1128/jvi.06594-11

The Cellular Antiviral Protein APOBEC3G Interacts with HIV-1 Reverse Transcriptase and Inhibits Its Function during Viral Replication

2012· article· en· W2085458745 sur OpenAlexafffund
Xiaoxia Wang, Zhujun Ao, Liyu Chen, Gary Kobinger, Jinyu Peng, Xiaojian Yao

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAPOBEC3GReverse transcriptaseCytidine deaminaseBiologyViral replicationTranscription (linguistics)VirologyRNAImmunoprecipitationZidovudineTranscription factorCell biologyMolecular biologyDNAVirusCell cultureGeneticsViral diseaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cytidine deaminase APOBEC3G (A3G) exerts a multifaceted antiviral effect against HIV-1 infection. First, A3G was shown to be able to terminate HIV infection by deaminating the cytosine residues to uracil in the minus strand of the viral DNA during reverse transcription. Also, a number of studies have indicated that A3G inhibits HIV-1 reverse transcription by a non-editing-mediated mechanism. However, the mechanism by which A3G directly disrupts HIV-1 reverse transcription is not fully understood. In the present study, by using a cell-based coimmunoprecipitation (Co-IP) assay, we detected the direct interaction between A3G and HIV-1 reverse transcriptase (RT) in produced viruses and in the cotransfected cells. The data also suggested that their interaction did not require viral genomic RNA bridging or other viral proteins. Additionally, a deletion analysis showed that the RT-binding region in A3G was located between amino acids 65 and 132. Overexpression of the RT-binding polypeptide A3G(65-132) was able to disrupt the interaction between wild-type A3G and RT, which consequently attenuated the anti-HIV effect of A3G on reverse transcription. Overall, this paper provides evidence for the physical and functional interaction between A3G and HIV-1 RT and demonstrates that this interaction plays an important role in the action of A3G against HIV-1 reverse transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,261

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations111
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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