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Enregistrement W2085639429 · doi:10.1002/humu.21560

Functional consequences and structural interpretation of mutations of human choline acetyltransferase

2011· article· en· W2085639429 sur OpenAlexaff
Xin‐Ming Shen, Thomas O. Crawford, Joan M. Brengman, Gyula Acsádi, Susan Iannaconne, Emin Karaca, Chaouky Khoury, Jean K. Mah, Simon Edvardson, Željko Bajzer, David W. Rodgers, Andrew G. Engel

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Center for Research ResourcesNational Institute on Drug Abuse
Mots-clésMissense mutationCholine acetyltransferaseBiologyMutantMutationEnzymeNonsense mutationGeneticsActive siteMolecular biologyBiochemistryCholinergicGeneEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Choline acetyltransferase (ChAT; EC 2.3.1.6) catalyzes synthesis of acetylcholine from acetyl-CoA (AcCoA) and choline in cholinergic neurons. Mutations in CHAT cause potentially lethal congenital myasthenic syndromes associated with episodic apnea (ChAT-CMS). Here, we analyze the functional consequences of 12 missense and one nonsense mutations of CHAT in 11 patients. Nine of the mutations are novel. We examine expression of the recombinant missense mutants in Bosc 23 cells, determine their kinetic properties and thermal stability, and interpret the functional effects of 11 mutations in the context of the atomic structural model of human ChAT. Five mutations (p.Trp421Ser, p.Ser498Pro, p.Thr553Asn, p.Ala557Thr, and p.Ser572Trp) reduce enzyme expression to less than 50% of wild-type. Mutations with severe kinetic effects are located in the active-site tunnel (p.Met202Arg, p.Thr553Asn, and p.Ala557Thr) or adjacent to the substrate binding site (p.Ser572Trp), or exert their effect allosterically (p.Trp421Ser and p.Ile689Ser). Two mutations with milder kinetic effects (p.Val136Met and p.Ala235Thr) are also predicted to act allosterically. One mutation (p.Thr608Asn) below the nucleotide binding site of CoA enhances dissociation of AcCoA from the enzyme-substrate complex. Two mutations introducing a proline residue into an α-helix (p.Ser498Pro and p.Ser704Pro) impair the thermal stability of ChAT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,367
Score d'incertitude au seuil0,228

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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