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Enregistrement W2085640997 · doi:10.1042/bj20041297

Nop53p is a novel nucleolar 60S ribosomal subunit biogenesis protein

2005· article· en· W2085640997 sur OpenAlexafffund
Yaroslav Sydorskyy, David J. Dilworth, Brendan P. Halloran, Eugene C. Yi, Taras Makhnevych, Richard W. Wozniak, John D. Aitchison

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchFondation pour la Recherche MédicaleUniversity of Alberta
Mots-clésRibosome biogenesisNucleolusRibosomal RNABiologyRibosomal proteinEukaryotic Large Ribosomal SubunitBiogenesisEukaryotic RibosomeRibosomeEukaryotic Small Ribosomal SubunitCell biologyRNA polymerase I5S ribosomal RNAProtein subunitPolysomeOrganelle biogenesisRNAGeneticsGeneCytoplasmRNA polymerase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ribosome biogenesis in Saccharomyces cerevisiae occurs primarily in a specialized nuclear compartment termed the nucleolus within which the rRNA genes are transcribed by RNA polymerase I into a large 35 S rRNA precursor. The ensuing association/dissociation and catalytic activity of numerous trans-acting protein factors, RNAs and ribosomal proteins ultimately leads to the maturation of the precursor rRNAs into 25, 5.8 and 18 S rRNAs and the formation of mature cytoplasmic 40 and 60 S ribosomal subunits. Although many components involved in ribosome biogenesis have been identified, our understanding of this essential cellular process remains limited. In the present study we demonstrate a crucial role for the previously uncharacterized nucleolar protein Nop53p (Ypl146p) in ribosome biogenesis. Specifically, Nop53p appears to be most important for biogenesis of the 60 S subunit. It physically interacts with rRNA processing factors, notably Cbf5p and Nop2p, and co-fractionates specifically with pre-60 S particles on sucrose gradients. Deletion or mutations within NOP53 cause significant growth defects and display significant 60 S subunit deficiencies, an imbalance in the 40 S:60 S ratio, as revealed by polysome profiling, and defects in progression beyond the 27 S stage of 25 S rRNA maturation during 60 S biogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil0,680

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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