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Enregistrement W2085812608 · doi:10.1139/b99-184

Phylogenetic relationships of<i>Cylindrocladium pseudogracile</i>and<i>Cylindrocladium rumohrae</i>with morphologically similar taxa, based on morphology and DNA sequences of internal transcribed spacers and beta-tubulin

2000· article· en· W2085812608 sur OpenAlexvenueno aff
P.W. Crous, Ji‐Chuan Kang, Conrad L. Schoch, Godwin R.A. Mchau

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeInternal transcribed spacerTaxonBotanyPhylogeneticsConidiumTaxonomy (biology)GeneRibosomal DNAMycologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unidentified strains of Cylindrocladium that were baited from soil in the Amazonas state of Brazil or isolated from Adiantum in the Netherlands were examined morphologically and analysed phylogenetically in comparison with reference strains. Phylogenetic trees inferred from the 5.8S subunit and flanking internal transcribed spacers (ITS1 and ITS2) of rDNA, as well as the beta-tubulin gene, separated species in accordance with their morphological features and characteristics. Although species differences based on ITS sequences were consistent, there were only a few informative sites available, making it difficult to clearly identify the unknown strains. Better resolution in separation of species was achieved from the beta-tubulin data. The strains baited from soil in Brazil were found to represent two species, namely Cylindrocladium gracile (Bugnic.) Boesew. and Cylindrocladium pseudogracile Crous. Morphologically, these two species are similar, except that the latter has slightly narrower, 1(-3)-septate conidia, and produces a Calonectria teleomorph. Furthermore, the strain from the Netherlands represents Cylindrocladium rumohrae El-Gholl &amp; Alfenas, a species previously known only from Panama. Results of this study also indicated that the beta-tubulin gene is phylogenetically more informative than the ITS regions for distinguishing species of Cylindrocladium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,736
Score d'incertitude au seuil0,696

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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