MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2085857772 · doi:10.5539/ijsp.v3n2p81

Estimating Statistical Measures of Pleiotropic and Epistatic Effects in the Genomic Era

2014· article· en· W2085857772 sur OpenAlexvenueno aff
Charles J. Mode

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Statistics and Probability · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBrigham and Women's Hospital
Mots-clésBiologyGeneticsEpistasisQuantitative trait locusLocus (genetics)AlleleGenomeQuantitative geneticsGenetic architectureGenotypeEvolutionary biologyGenetic variationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent developments in the technology for sequencing the genomes of various species has had a profound effect of the working paradigms of various fields of genetics. Included among these fields is the classical field of quantitative genetics, which is a subfield of statistical genetics, that is devoted to traits that can be quantified on some continuous scale and are often influenced by alleles at many loci. In recent years, many investigators have conducted genome wide sweeps and have used a variety of statistical criteria to judge whether identified regions of the human genome have a significant influence on the expression of some quantitative trait such as measurements on patients with Alzheimer's disease. From the point of view of quantitative genetics, the regions of a genome that have some influence on a quantitative trait may be viewed as loci, and variations among these loci at the $DNA$ level, such as nucleotide substitutions or other markers, may be used as working definitions of alleles, and, therefore, can be used to determine whether an individual carries a particular allele at some locus. Given such data, an investigator can identify the genotype of each individual in a study, with respect to the loci under consideration as well as the two alleles present at each locus in a diploid species such as man. This ability to use these working definitions to identify the genotype of each individual in a sample results in a significant change in the working paradigm of sub-field of quantitative genetics, called variance and covariance analysis, because effects and components of variance and covariance may be estimated directly in a sense that will be described in detail in the paper.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,343
Score d'incertitude au seuil0,164

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of Statistics and ProbabilityMême sujetGenetic Mapping and Diversity in Plants and AnimalsTravaux en français237 207