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Enregistrement W2086086450 · doi:10.4141/cjas07121

Cloning of porcine proglucagon and effect of commensal bacteria on relative gene expression in the intestine of gnotobiotic pigs

2008· article· en· W2086086450 sur OpenAlexvenueno aff
Richard H. Siggers, T. W. Shirkey, Murray D. Drew, B. Laarveld, Andrew G. Van Kessel

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Animal Science · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntibiotics Pharmacokinetics and Efficacy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProglucagonBiologyEscherichia coliGeneLactobacillus fermentumGene expressionBacteriaMolecular biologyCloning (programming)Nucleic acid sequenceMicrobiologyBiochemistryGlucagon-like peptide-1GeneticsEndocrinologyLactic acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Porcine proglucagon mRNA sequence was determined by designing primers based on homologous regions in bovine and human genes. The porcine sequence shared 90% nucleotide identity with human proglucagon; however, predicted Ser159Arg and Leu160Lys substitutions were observed. This newly identified sequence suggests that the intestinal trophic peptide, glucagon-like peptide 2 (GLP-2), is actually 35 amino acids in the pig rather than 33 amino acids, as previously reported. To determine the effect of different bacteria on intestinal proglucagon gene expression, 16 piglets were reared in gnotobiotic isolators maintained germ-free (GF), monoassociated with Lactobacillus fermentum (LF) or Escherichia coli (EC), or conventionalized (CV) in two separate experiments for 13 d. Cultured cecal contents confirmed microbial status with the exception of GF pigs in exp. 2, which were contaminated with Staphylococcus epidermidis (SE). Mean fold differences in ileal proglucagon expression (CV set to 1) were 1.0ab, 1.6a, 0.7b, 1.0ab for GF, LF, EC and CV in exp. 1 and 4.0a, 2.0b, 0.6c, 1.0c for SE, LF, EC and CV groups in exp. 2, respectively. This study, for the first time, accurately describes the full nucleotide sequence for porcine proglucagon, and shows that proglucagon expression is differentially regulated by bacteria colonizing intestine of neonatal piglets. Key words: Proglucagon, gnotobiotic, pig, gene expression, intestine

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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