MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2086152189 · doi:10.1034/j.1600-0609.2003.02838.x

Surface antigen expression and correlation with variable heavy‐chain gene mutation status in chronic lymphocytic leukemia

2003· article· en· W2086152189 sur OpenAlexfundno aff
Juhani Vilpo, Gerard Tobin, Janne Hulkkonen, Mikko Hurme, Ulf Thunberg, Christer Sundström, Leena Vilpo, Richard Rosenquist

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal Of Haematology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Lymphocytic Leukemia Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilTaysFondation pour la Recherche MédicaleCancer Research Society
Mots-clésChronic lymphocytic leukemiaCD38CD5AntigenBiologyIGHV@Immunoglobulin DMolecular biologySurface ImmunoglobulinImmunophenotypingCD23CD20ImmunologyAntibodyLeukemiaB cellGeneticsImmunoglobulin E

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent studies have demonstrated that B-cell chronic lymphocytic leukemia (CLL) consists of two clinical entities with either somatically hypermutated (M-CLL) or unmutated (UM-CLL) immunoglobulin variable heavy-chain (VH) regions. In view of the fact that the cellular biology of these two subsets of disease is currently unexplored, we performed an extensive analysis of the surface antigen expression and correlated this with the VH gene mutation status in a cohort of 32 CLL patients. Using polymerase chain reaction amplification and nucleotide sequencing, the VH genes were shown to be mutated in 10 cases (31%) and unmutated in 22 (69%). The expression of 27 surface membrane antigens in peripheral blood leukemic cells was analyzed by flow cytometry, measuring both the percentage of positive cells as well as the geometric mean fluorescence intensity (GMF). Most of the surface membrane antigens (CD5, CD11c, CD19, CD20, CD21, CD22, CD23, CD25, CD40, CD45, VD79b, CD80, CD95, CD122, CD124, CD126, CD130, CD154, IgM, and IgD) showed a similar expression pattern in both UM-CLL and M-CLL patients. The similarity of M-CLL and UM-CLL, as demonstrated here for the first time with many protein markers, indicates a considerably homogeneous phenotype in both subsets. Furthermore, CD27 was strongly expressed in all cases, which may suggest a memory cell phenotype for both M-CLL and UM-CLL. More positive cells in the UM-CLL group were observed regarding CD38, but CD38 was not a good predictor of VH gene mutation status. Seventy percent of the M-CLL cases, but only 36% of UM-CLL cases, were Ig-lambda+. The most striking differential expression, however, was observed in the two slicing variants of the common leukocyte antigen CD45, namely CD45RO and CD45RA. CD45RO expression was significantly associated with M-CLL, whereas the GMF intensity of CD45RA tended to be associated with UM-CLL. The role of these CD45 splicing variants in the pathogenesis of CLL deserves further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEuropean Journal Of HaematologyMême sujetChronic Lymphocytic Leukemia ResearchTravaux en français237 207