Mutation screen and association analysis of the glucocorticoid receptor gene (<i>NR3C1</i>) in childhood‐onset mood disorders (COMD)
Notice bibliographique
Résumé
Depressive disorders are highly heterogeneous psychiatric disorders involving deficits to cognitive, psychomotor, and emotional processing. Considerable evidence links disruption to the hypothalamic-pituitary-adrenal (HPA) axis to the etiology of depression, with specific deficits reported in glucocorticoid receptor (GR)-mediated negative feedback. Given the role of GR-mediated negative feedback in mediating response to stress, and the clear link between stress and depression, it is plausible that polymorphisms in the GR gene (NR3C1) act to increase susceptibility. Maternal behavior in rats epigenetically alters a NGF1-A transcription factor binding-site in the promoter region of the GR gene, providing a mechanism by which environmental cues can regulate GR expression and thus response to stress. The analogous region of the human GR gene (NR3C1) has not been studied, but it is possible that polymorphisms in this region may alter the binding of transcription factors known to regulate GR expression. In this study, we have performed bioinformatic analyses on the promoter region of NR3C1 to identify conserved promoter sequences and predicted transcription factor binding sites. These regions were screened with denaturing high-performance liquid chromatography (DHPLC) and direct re-sequencing, and several novel polymorphic variants were identified. We genotyped nine polymorphisms across NR3C1 in a large sample of Hungarian nuclear families ascertained through affected probands with a diagnosis of childhood-onset mood disorders (COMD). Single-marker analysis provided little evidence for an association of this gene with COMD, but multi-marker analysis across a region of high linkage disequilibrium revealed modest evidence for the biased transmission of several haplotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».