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Enregistrement W2086227929 · doi:10.1002/pmic.200900810

Redox‐sensitive proteome and antioxidant strategies in wheat seed dormancy control

2011· article· en· W2086227929 sur OpenAlexaff
Natalia V. Bykova, Brenda Hoehn, Christof Rampitsch, Travis Banks, Tao Fan, R. E. Knox

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDormancyProteomeAntioxidantBiochemistryBiologyRedoxSeed dormancyAbscisic acidProteomicsStorage proteinImbibitionCell biologyGerminationChemistryBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oxidative signalling by ROS has been demonstrated to play a role in seed dormancy alleviation, but the detailed molecular mechanisms underlying this process remain largely unknown. Here, we show dynamic differences in redox-sensitive proteome upon wheat seed dormancy release. Using thiol-specific fluorescent labelling, solubility-based protein fractionation, 2-D IEF PAGE, and MS analysis in conjunction with wheat EST sequence libraries, proteins with reversible oxidoreductive changes were characterized. Altogether, 193 reactive Cys were found in 79 unique proteins responding differentially in dormant, non-dormant, abscisic, or gibberellic acid-treated seed protein extracts from RL4137, a wheat cultivar with extreme dormancy. The identified proteins included groups that are redox-, stress-, and pathogen-responsive, involved in protein synthesis and storage, are enzymes of carbohydrate metabolism, proteases, and those involved in transport and signal transduction. Two types of redox response could be detected: (i) a dramatic increase in protein thiol redox state in seeds during imbibition and hormonal treatment; (ii) higher antioxidant capacity related to sensing of a threshold redox potential and balancing the existing redox pools, in dry dormant versus non-dormant seeds. These results highlight occurrence of the antioxidant defence mechanisms required for the protection of seed during a dormancy stage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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