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Enregistrement W2086331395 · doi:10.1158/0008-5472.fbcr09-a54

Abstract A54: CnABP, a novel modulator of the Calcineurin-NFAT signaling pathway, is overexpressed in Wilms' tumors and promotes cell migration

2009· article· en· W2086331395 sur OpenAlexaff
Alana H.T. Nguyen, Mélanie Béland, Yaned Gaitan, Maxime Bouchard

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNFATCalcineurinBiologyCancer researchMolecular biologyCell growthPronephrosCell biologyInternal medicineTransplantationGeneBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Wilms' tumor (WT) is a classical cancer type that arises from abnormal differentiation of kidney progenitor cells, and occurs at a frequency of 1 in 10,000 live births, accounting for approx. 90% of childhood kidney cancer. Abnormally high levels of Pax2 (paired-box protein 2), a key regulator of kidney development, have been observed in both WT and renal cell carcinoma, which correlate with proliferation and increased invasiveness. Therefore the misexpression of Pax2 and its target genes may play an important role in tumor initiation and/or progression. To test this, we screened for target genes of Pax2 by cDNA microarray in the embryonic kidney. We identified CnABP (Calcineurin A Binding Protein), a novel gene under Pax2 regulation. In situ hybridization indicates that CnABP coexpresses with Pax2 in the condensing mesenchyme, the abnormal differentiation of which gives rise to WT. Furthermore, expression analysis by quantitative PCR indicates that CnABP is overexpressed in more than 70% of Wilms' tumors. Interestingly, in the proportion of tumors with upregulated PAX2 expression, more than 80% also overexpress CnABP. We characterized CnABP as a membrane-anchored protein that primarily promotes cell proliferation and migration. Mediators of these activities were investigated by Yeast-two-hybrid and immunoprecipitation, which identified an interaction between CnABP and Calcineurin A, the catalytic subunit of a calcium-responsive serine/threonine phosphatase Calcineurin. We showed that CnABP modulates phosphatase activities of Calcineurin, which consequently inhibits calcium/Calcineurin-dependent NFAT nuclear translocation. We further demonstrated that the inhibition of NFAT nuclear localization results in reduced NFAT-specific transcriptional activity. Components of the Calcineurin complex have been reported as differentially expressed genes distinguishing recurrent from non-recurrent Wilms' tumors. This is in line with the evidence we presented, as CnABP is upregulated in Wilms' tumors and is shown to promote proliferation and migration. Citation Information: Cancer Res 2009;69(23 Suppl):A54.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
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Résumé présentoui

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