Structures of Hydrated Li<sup>+</sup>−Thymine and Li<sup>+</sup>−Uracil Complexes by IRMPD Spectroscopy in the N−H/O−H Stretching Region
Notice bibliographique
Résumé
The interaction of lithium ions with two pyrimidine nucleobases, thymine and uracil, as well as the solvation of various complexes by one and two water molecules, has been studied in the gas phase. IRMPD spectra are reported for each of B-Li(+)-(H(2)O)(n) (n = 1-2) and B(2)-Li-(H(2)O)(m) (m = 0-1) for B = thymine, uracil over the 2500-4000 cm(-1) region. Calculations were performed using the B3LYP density functional in conjunction with the 6-31+G(d,p) basis set to model the vibrational spectra as well as MP2/6-311++G(2d,p) theory to model the thermochemistry of potential structures. Experimental and theoretical results were used in combination to determine structures of each complex, which are reported here. The lithium cation in all complexes was found to bond to the O4 oxygen in both thymine and uracil, and the first two water molecules of solvation were found to bond to Li(+). The experimental spectra obtained for BLi(+)(H(2)O)(n) (n = 1-2) and B(2)Li(+) for thymine and uracil clearly resemble one another, suggesting similar structural features in terms of bonding between the base and Li(+), as well as for solvation. This was confirmed through theoretical work. The addition of water to the lithium ion-bound DNA base dimers has been shown to induce a significant change in structure of the dimer to a hydrogen-bonded system similar to base pairing in the Watson-Crick model of DNA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».