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Enregistrement W2086434567 · doi:10.1242/jcs.052761

VAMP3, syntaxin-13 and SNAP23 are involved in secretion of matrix metalloproteinases, degradation of the extracellular matrix and cell invasion

2009· article· en· W2086434567 sur OpenAlexaff
Michelle J. Kean, Karla C. Williams, Michael Skalski, Dennis W Myers, Angela Burtnik, David A. Foster, Marc G. Coppolino

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCell biologySecretionSNAP23SyntaxinMMP9Matrix metalloproteinaseExtracellular matrixEndosomeExocytosisMembrane proteinIntracellularBiochemistryDownregulation and upregulationMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cellular remodeling of the extracellular matrix (ECM), an essential component of many physiological and pathological processes, is dependent on the trafficking and secretion of matrix metalloproteinases (MMPs). Soluble NSF attachment protein receptor (SNARE)-mediated membrane traffic has documented roles in cell-ECM interactions and the present study specifically examines SNARE function in the trafficking of MMPs during ECM degradation. Using the invasive human fibrosarcoma cell line HT-1080, we demonstrate that a plasma membrane SNARE, SNAP23, and an endosomal v-SNARE, VAMP3 (also known as cellubrevin), partly colocalize with MMP2 and MMP9, and that inhibition of these SNAREs using dominant-negative SNARE mutants impaired secretion of the MMPs. Inhibition of VAMP3, SNAP23 or syntaxin-13 using dominant-negative SNARES, RNA interference or tetanus toxin impaired trafficking of membrane type 1 MMP to the cell surface. Consistent with these observations, we found that blocking the function of these SNAREs reduced the ability of HT-1080 cells to degrade a gelatin substrate in situ and impaired invasion of HT-1080 cells in vitro. The results reveal the importance of VAMP3, syntaxin-13 and SNAP23 in the trafficking of MMP during degradation of ECM substrates and subsequent cellular invasion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations118
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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