Polymorphic mutations of the Mn-SOD gene in intact human lymphocytes and oral squamous cell carcinoma cell lines
Notice bibliographique
Résumé
Mutations of the superoxide dismutase (SOD) genes are associated with neoplastic and non-neoplastic diseases. However, the existence of polymorphic mutations of manganese SOD (Mn-SOD) has not been explored in squamous cell carcinoma (SCC) cells or in normal cells. In the present study, we examined mutations in the 5' flanking region of the Mn-SOD gene and Mn-SOD mRNA using 10 human oral SCC (OSC) cell lines and intact lymphocytes obtained from 10 healthy donors and one patient with OSC. The polymerase chain reaction products of DNA obtained from lymphocytes revealed insertions at many sites (-1833, -1575, -1093, -1056, -325, -318, and -310) in 10 of the 11 donors. Transitions and (or) transversions were also observed at -1638 and -216 in lymphocytes from six donors and one donor, respectively. In DNA obtained from OSC cells, insertions and transitions and (or) transversions were more frequent than those in DNA from lymphocytes. In addition, deletions at -1341 and -1288 were observed in all lines except for one line. In these mutations, the transcription factor binding sites were not involved except for the AP-2 binding site (-102) in three cell lines. In Mn-SOD mRNA, Val at -9 position was varied to Ala in lymphocytes from two donors and three OSC cell lines, respectively. In the remaining cell lines, Mn-SOD mRNA from lymphocytes and OSC cell lines revealed heterozygosity (Ala/Val) and homozygosity (Val/Nal), respectively. The Mn-SOD activities in lymphocytes were 3.8-5.8 x 10(-4) U/10(6) cells and the activities in OSC cell lines were 1.8-8.3 x 10(-4) U/10(6) cells. These Mn-SOD activities were not correlated with the mutations of DNA and mRNA. From these results, it is indicated that polymorphic mutations of Mn-SOD exist in human normal cells and that the deletions might be obtained in the course of malignant transformation of OSC although decrease in Mn-SOD activity is not involved in the transformation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».