MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2086510987 · doi:10.1371/journal.pone.0119061

DNA Methylation of the Serotonin Transporter Gene in Peripheral Cells and Stress-Related Changes in Hippocampal Volume: A Study in Depressed Patients and Healthy Controls

2015· article· en· W2086510987 sur OpenAlexafffund
Linda Booij, Moshe Szyf, Angela Carballedo, Eva-Maria Frey, Derek W. Morris, Sergiy Dymov, Farida Vaisheva, Victoria Ly, Ciara Fahey, James F. Meaney, Michael Gill, Thomas Frodl

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueChild and Adolescent Psychosocial and Emotional Development
Établissements canadiensQueen's UniversityMcGill UniversityUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchScience Foundation IrelandNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionGlaxoSmithKline
Mots-clésSerotonin transporterSerotonergicSerotoninDNA methylationMethylationHippocampal formationCpG siteHippocampusEpigeneticsSerotonin Plasma Membrane Transport ProteinsBiologyInternal medicineEndocrinologyPsychologyNeuroscienceMedicineGeneticsGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Serotonin plays an important role in the etiology of depression. Serotonin is also crucial for brain development. For instance, animal studies have demonstrated that early disruptions in the serotonin system affect brain development and emotion regulation in later life. A plausible explanation is that environmental stressors reprogram the serotonin system through epigenetic processes by altering serotonin system gene expression. This in turn may affect brain development, including the hippocampus, a region with dense serotonergic innervations and important in stress-regulation. The aim of this study was to test whether greater DNA methylation in specific CpG sites at the serotonin transporter promoter in peripheral cells is associated with childhood trauma, depression, and smaller hippocampal volume. We were particularly interested in those CpG sites whose state of methylation in peripheral cells had previously been associated with in vivo measures of brain serotonin synthesis. Thirty-three adults with Major Depressive Disorder (MDD) (23 females) and 36 matched healthy controls (21 females) were included in the study. Depressive symptoms, childhood trauma, and high-resolution structural MRI for hippocampal volume were assessed. Site-specific serotonin transporter methylation was assessed using pyrosequencing. Childhood trauma, being male, and smaller hippocampal volume were independently associated with greater peripheral serotonin transporter methylation. Greater serotonin transporter methylation in the depressed group was observed only in SSRI-treated patients. These results suggest that serotonin transporter methylation may be involved in physiological gene-environment interaction in the development of stress-related brain alterations. The results provide some indications that site-specific serotonin transporter methylation may be a biomarker for serotonin-associated stress-related psychopathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,312

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations175
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetChild and Adolescent Psychosocial and Emotional DevelopmentTravaux en français237 207