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Enregistrement W2086552186 · doi:10.1097/fpc.0b013e32832a06bf

IgG1 heavy chain-coding gene polymorphism (G1m allotypes) and development of antibodies-to-infliximab

2009· article· en· W2086552186 sur OpenAlexaff
Charlotte Magdelaine–Beuzelin, Séverine Vermeire, Margaret Goodall, Filip Baert, Maja Noman, Gert Van Assche, Marc Ohresser, Danielle Degenne, Jean‐Michel Dugoujon, Roy Jefferis, Paul Rutgeerts, Marie‐Paule Lefranc, Hervé Watier

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAllotypeGenotypingBiologyImmunogeneticsAntibodyInfliximabGeneticsImmunologyGene polymorphismAllelePopulationGenotypeGeneTumor necrosis factor alphaMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: The chimeric anti-tumor necrosis factor-alpha antibody infliximab is known to induce antibodies-to-infliximab (ATI) in some treated patients. Immunogenicity in murine variable domains is expected; however, constant domains of its human heavy gamma1 chain may also be implicated as it expresses G1m1 and G1m17 allotypes. This allelic form may be immunogenic in patients that are homozygous for the G1m3 allotype commonly expressed in Caucasoid populations. METHODS: As G1m allotypic divergence may explain the presence of ATI or may influence their concentration, a genotyping method was developed and validated to determine antithetical (i.e. mutually exclusive) G1m3 and G1m17 allotypes (amino acid 120 of CH1 according to the international ImMunoGeneTics information system unique numbering) at the IGHG1 gene level (CH1 359g/a nucleotide polymorphism). Two hundred forty-five blood donors and 118 previously described patients suffering from Crohn's disease, treated with infliximab, and having developed ATI in 73 of them, were genotyped. RESULTS: The IGHG1 CH1 359g/a polymorphism does not depart from the Hardy-Weinberg equilibrium in the control population, and allele frequencies were similar in controls and patients. No association was found between the patient G1m allotypes and the presence of ATI or their concentration. It remains possible that anti-Gm1 antibodies are not well detected by the enzyme-linked immunosorbent assays used for ATI detection and/or that the G1m allotypes are minor antigens on IgG1. CONCLUSION: The IGHG1 polymorphism does not seem to play a major role in the induction of ATI. Further analyses will be required to determine whether it is also the case for humanized or fully human antibodies bearing the same G1m allotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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