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Enregistrement W2086607206 · doi:10.2174/1570162043484988

The Selective Packaging and Annealing of Primer tRNALys3 in HIV-1

2004· review· en· W2086607206 sur OpenAlexaff
Lawrence Kleiman, Rabih Halwani, Hassan Javanbakht

Notice bibliographique

RevueCurrent HIV Research · 2004
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrimer (cosmetics)Human immunodeficiency virus (HIV)ChemistryBiologyVirologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In HIV-1, tRNA(Lys3) serves as the primer for reverse transcriptase, and during viral assembly, the tRNA(Lys) isoacceptors, tRNA(Lys1,2) and tRNA(Lys3), are selectively packaged into the virion. In this review, we shall first discuss the evidence for the formation of a tRNA(Lys) packaging complex, whose components include Gag, GagPol, genomic RNA, lysyl-tRNA synthetase (LysRS), and tRNA(Lys). Evidence suggests that the formation of this complex involves a Gag/GagPol/viral genomic RNA complex interacting with a tRNA(Lys)/ LysRS complex, with Gag interacting with both GagPol and LysRS, and GagPol interacting with the tRNA(Lys). The interaction of Gag with LysRS is quite specific, does not require the presence of tRNA(Lys), and LysRS is believed to be the target that allows the specific packaging of tRNA(Lys) into the virion. The parameters influencing these interactions, and the molecular sites of interaction, will be discussed. The selective packaging of tRNA(Lys3) into HIV-1 facilitates annealing of tRNA(Lys) to the 5' region of viral RNA genome. This region contains a series of stem loops, and there exists several regions in both the viral RNA and the tRNA(Lys) that are believed to be important for tRNA(Lys) annealing. The annealing is facilitated by viral proteins such as unprocessed Gag, nucleocapsid, and reverse transcriptase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,995
Score d'incertitude au seuil0,411

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,137
Tête enseignante GPT0,473
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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