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Enregistrement W2086620006 · doi:10.1073/pnas.0705571104

The oxysterol binding protein Kes1p regulates Golgi apparatus phosphatidylinositol-4-phosphate function

2007· article· en· W2086620006 sur OpenAlexaff
Gregory D. Fairn, Amy J. Curwin, Christopher J. Stefan, Christopher R. McMaster

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignUniversity College London
Mots-clésGolgi apparatusPhosphatidylinositolVesicular transport proteinCell biologyBiologyGTPasePleckstrin homology domainBiochemistryPhosphatidylcholineTransport proteinRabMutantPhospholipidVesicleSignal transductionGeneEndoplasmic reticulumMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Saccharomyces cerevisiae phosphatidylcholine/phosphatidylinositol transfer protein Sec14p is required for Golgi apparatus-derived vesicular transport through coordinate regulation of phospholipid metabolism. Sec14p is normally essential. The essential requirement for SEC14 can be bypassed by inactivation of (i) the CDP-choline pathway for phosphatidylcholine synthesis or (ii) KES1, which encodes an oxysterol binding protein. A unique screen was used to determine genome-wide genetic interactions for the essential gene SEC14 and to assess whether the two modes of "sec14 bypass" were similar or distinct. The results indicate that inactivation of the CDP-choline pathway allows cells with inactivated SEC14 to live through a mechanism distinct from that of inactivation of KES1. We go on to demonstrate an important biological function of Kes1p. Kes1p regulates Golgi apparatus-derived vesicular transport by inhibiting the function of Pik1p-generated Golgi apparatus phosphatidylinositol-4-phosphate (PI-4P). Kes1p affects both the availability and level of Golgi apparatus PI-4P. A set of potential PI-4P-responsive proteins that include the Rab GTPase Ypt31p and its GTP exchange factor are described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,278

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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