Characterization of a bovine cDNA encoding citrate synthase, and presence of citrate synthase mRNA during bovine pre-attachment development
Notice bibliographique
Résumé
Citrate synthase is a key regulatory metabolic enzyme that catalyzes the first step in the tricarboxylic acid (TCA) cycle, the synthesis of citrate from acetyl coenzyme A and oxaloacetate. Aerobic metabolism via the TCA cycle is high in bovine embryos at the 4-cell stage then decreases until the compact morula stage before increasing at the expanded blastocyst stage. This study characterizes the presence of citrate synthase mRNA in bovine pre-attachment embryos to determine if a variation in mRNA transcript expression patterns is associated with previous reports of the patterns of TCA cycle activity. The reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) method was used to detect citrate synthase mRNA from the 1-cell to blastocyst stage of bovine embryo development, and in embryos cultured under either an atmosphere of 5% CO(2) in air or 5% CO(2)/5% O(2)/90%N(2). The nucleotide sequence encoding citrate synthase was determined from bovine heart cDNA by the rapid amplification of cDNA ends (RACE) technique. This 1455-bp nucleotide fragment contained an open reading frame that encoded a deduced protein of 466 amino acids. The bovine nucleotide sequence was 92.1% and 93.8% identical to the human and porcine coding sequence, respectively. The amino acid sequence predicted from the bovine sequence is 95.1% identical to the human sequence and 96.3% identical to the porcine sequence. The porcine sequence contains a stop codon that results in a peptide truncated by 2 amino acids. The detection of citrate synthase transcripts from the 1-cell to blastocyst stage demonstrates that the decrease in TCA cycle activity observed following the 4-cell stage is not associated with an absence of citrate synthase mRNA.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».