MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2086752889 · doi:10.1093/nar/gkn1003

Structural analysis of DNA complexation with cationic lipids

2008· article· en· W2086752889 sur OpenAlexaff
R. Marty, Christophe N. N’soukpoé-Kossi, Duane Charbonneau, C. M. Weinert, Laurent Kreplak, H.A. Tajmir‐Riahi

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensUniversité du QuébecDalhousie UniversityUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNACircular dichroismCationic polymerizationCationic liposomeBinding constantLiposomeCrystallographyLipid bilayerBiophysicsBiologyBiochemistryChemistryBinding siteOrganic chemistryMembraneTransfectionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Complexes of cationic liposomes with DNA are promising tools to deliver genetic information into cells for gene therapy and vaccines. Electrostatic interaction is thought to be the major force in lipid-DNA interaction, while lipid-base binding and the stability of cationic lipid-DNA complexes have been the subject of more debate in recent years. The aim of this study was to examine the complexation of calf-thymus DNA with cholesterol (Chol), 1,2-dioleoyl-3-trimethylammonium-propane (DOTAP), dioctadecyldimethylammoniumbromide (DDAB) and dioleoylphosphatidylethanolamine (DOPE), at physiological condition, using constant DNA concentration and various lipid contents. Fourier transform infrared (FTIR), UV-visible, circular dichroism spectroscopic methods and atomic force microscopy were used to analyse lipid-binding site, the binding constant and the effects of lipid interaction on DNA stability and conformation. Structural analysis showed a strong lipid-DNA interaction via major and minor grooves and the backbone phosphate group with overall binding constants of K(Chol) = 1.4 (+/-0.5) x 10(4) M(-1), K(DDAB) = 2.4 (+/-0.80) x 10(4) M(-1), K(DOTAP) = 3.1 (+/-0.90) x 10(4) M(-1) and K(DOPE) = 1.45 (+/- 0.60) x 10(4) M(-1). The order of stability of lipid-DNA complexation is DOTAP>DDAB>DOPE>Chol. Hydrophobic interactions between lipid aliphatic tails and DNA were observed. Chol and DOPE induced a partial B to A-DNA conformational transition, while a partial B to C-DNA alteration occurred for DDAB and DOTAP at high lipid concentrations. DNA aggregation was observed at high lipid content.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations168
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNucleic Acids ResearchMême sujetRNA Interference and Gene DeliveryTravaux en français237 207