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Enregistrement W2086801650 · doi:10.1139/w06-060

A mutation in an<i>exbD</i>gene reduces tagetitoxin production by<i>Pseudomonas syringae</i>pv.<i>tagetis</i>

2006· article· en· W2086801650 sur OpenAlexvenueno aff
Hyesuk Kong, C.D. Patterson, R. E. Mitchell, Jeffrey S. Buyer, M. Catherine Aime, John E. Lydon

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPseudomonas syringaeMutantTransposon mutagenesisMutagenesisTransposable elementGeneMicrobiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A mutant of Pseudomonas syringae pv. tagetis EB037 with limited ability to produce tagetitoxin was isolated after transposon mutagenesis and the mutation was characterized. The mutation occurred in a gene with a high degree of sequence identity to exbD. exbD is contiguous with tonB and exbB upstream and with a gene for a TonB-dependent receptor downstream. Using reverse transcription - polymerase chain reaction with RNA from the wild-type and exbD mutant strains, we demonstrated that the mutation in exbD did not have a polar affect on the expression of downstream genes. The exbD mutant was able to grow well in conditions where iron is not freely available. Siderophore production by the exbD mutant was similar to that of the wild-type strain. We conclude that the mutation in exbD disrupts tagetitoxin production without compromising iron metabolism. The results indicate that tagetitoxin export by P. syringae pv. tagetis involves an efflux pump that requires a functional TonB system that is not essential for normal iron metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,207
Score d'incertitude au seuil0,825

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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