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Enregistrement W2086817799 · doi:10.1093/carcin/bgu228

Whole-miRNome profiling identifies prognostic serum miRNAs in esophageal adenocarcinoma: the influence of Helicobacter pylori infection status

2014· article· en· W2086817799 sur OpenAlexaff
Rihong Zhai, Yongyue Wei, Li Su, Geoffrey Liu, M. Kulke, John C. Wain, David C. Christiani

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteMassachusetts General Hospital
Mots-clésInternal medicineProportional hazards modelHelicobacter pyloriMedicineGastroenterologyOncologySurvival analysisMultivariate analysisAdenocarcinomaCohortCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell free circulating microRNAs (cfmiRNAs) have been recognized as robust and stable biomarkers of cancers. However, little is known about the prognostic significance of cfmiRNAs in esophageal adenocarcinoma (EA). In this study, we explored whether specific cfmiRNA profiles could predict EA prognosis and whether Helicobacter pylori (HP) infection status could influence the association between cfmiRNAs and EA survival outcome. We profiled 1075 miRNAs in pooled serum samples from 30 EA patients and 30 healthy controls. The most relevant cfmiRNAs were then assessed for their associations with EA survival in an independent cohort of 82 patients, using Log-rank test and multivariate Cox regression models. Quantitative real-time PCR (qRT-PCR) was used for cfmiRNA profiling. HP infection status was determined by immunoblotting assay. We identified a panel of 18 cfmiRNAs that could distinguish EA patients from healthy subjects (P = 3.0E-12). In overall analysis and in HP-positive subtype patients, no cfmiRNA was significantly associated with EA prognosis. In HP-negative patients, however, 15 cfmiRNAs were significantly associated with overall survival (OS) (all P < 0.05). A combined 2-cfmiRNA (low miR-3935 and high miR-4286) risk score was constructed; that showed greater risk for worse OS (HR = 2.22, P = 0.0019) than individual cfmiRNA alone. Patients with high-risk score had >10-fold increased risk of death than patients with low risk score (P = 0.0302; HR = 10.91; P = 0.0094). Our findings suggest that dysregulated cfmiRNAs may contribute to EA survival outcome and HP infection status may modify the association between cfmiRNAs and EA survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,139
Score d'incertitude au seuil0,636

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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