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Enregistrement W2086847004 · doi:10.1111/j.1460-9568.2006.04947.x

Role of the synprint site in presynaptic targeting of the calcium channel Ca<sub>V</sub>2.2 in hippocampal neurons

2006· article· en· W2086847004 sur OpenAlexafffund
Zsolt Szabó, Gerald J. Obermair, Conan B. Cooper, Gerald W. Zamponi, Bernhard E. Flucher

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neuroscience · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesOesterreichische NationalbankCanadian Institutes of Health ResearchAustrian Science Fund
Mots-clésGreen fluorescent proteinHippocampal formationVoltage-dependent calcium channelSynaptic vesicleCalcium channelBiologyProtein subunitCell biologyFusion proteinNeuroscienceR-type calcium channelN-type calcium channelChemistryT-type calcium channelCalciumBiochemistryVesicleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sequences in the cytoplasmic II-III loop of CaV2 voltage-gated calcium channels, termed the synaptic protein interaction (synprint) site, are considered important for the functional incorporation of presynaptic calcium channels into the synaptic vesicle fusion apparatus. Two novel CaV2.2 splice variants lack large parts of the cytoplasmic II-III loop (Delta1 R756-L1139, Delta2 K737-A1001) including the synprint protein-protein interaction domain. Here we expressed green fluorescent protein (GFP)-alpha1B subunit fusion constructs of CaV2.2 splice variants in mouse hippocampal neurons to study their distribution in distinct neuronal compartments and to address the question of whether and how the synprint site functions in the presynaptic targeting of N-type calcium channels. Similar to full-length GFP-alpha1B but divergent from the somatodendritic alpha1C-HA (CaV1.2) channel type, the splice variants GFP-alpha1B-Delta1 and GFP-alpha1B-Delta2 were targeted into the axons. Nevertheless, their ability to form bona fide presynaptic clusters was almost abolished for GFP-alpha1B-Delta1 and significantly reduced for GFP-alpha1B-Delta2. Thus, the synprint site is important for normal synaptic targeting of CaV2.2 but not essential. Conversely, insertion of the synprint site into the II-III loop of alpha1C-HA did not restore axonal targeting or synaptic clustering. Together these results indicate that protein-protein interactions with the synprint site must cooperate with other targeting mechanisms in the incorporation of CaV2.2 into presynaptic specializations of hippocampal neurons but are neither necessary nor sufficient for axonal targeting. The unique targeting properties of the splice variants lacking the synprint site are suggestive of specific functions of these calcium channels apart from activating fast synaptic transmission.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,518
Score d'incertitude au seuil0,215

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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