<i>Pseudomonas aeruginosa</i> O‐antigen chain length is determined before ligation to lipid A core
Notice bibliographique
Résumé
Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative opportunistic pathogen that infects immunocompromised patients and trauma victims and causes fatal lung infections in people with cystic fibrosis. This microorganism produces a number of virulence factors, one of which is lipopolysaccharide (LPS), which has been shown to mediate many biological effects including resistance to serum killing and phagocytosis. These biological activities have been correlated to the length of the O-polysaccharide and its distribution on the outer membrane. Wzz is responsible for regulation of the size distribution of the O-antigen. Wzz has been found to participate solely in the Wzy-dependent pathway for LPS biosynthesis, which produces heteropolymeric O-polysaccharide such as the B-band LPS of P. aeruginosa. Our laboratory has previously reported characterization of a Wzz protein encoded in the B-band O-antigen biosynthesis cluster of PAO1. The availability of the genome sequence of P. aeruginosa PAO1 has made it possible to identify a second functional Wzz protein (PA0938, Wzz2). Gene replacement was used to generate an unmarked wzz2delta knock-out and a wzz2delta/wzz1::Gm double knock-out. As expected, the wzz2delta strain produced LPS with modal length imparted by Wzz1, and the wzz2delta/wzz1::Gm strain produced LPS O-antigen with a non-modal (random) length. Both wzz1 and wzz2 from P. aeruginosa PAO1 were cloned and expressed with an N-terminal His6 tag. His6-Wzz1 and His6-Wzz2 were purified to near homogeneity by immobilized metal affinity chromatography (IMAC). These preparations were used to develop specific polyclonal antibodies against each of the proteins. In vivo protein cross-linking followed by Western immunoblotting indicated that Wzz1 forms dimers whereas Wzz2 forms octamers. By generation of a wzz2delta/rmlC double mutant and analysis of the LPS, we have made the novel observation that polymerization of modal chain length-distributed O-antigen occurred before ligation to the lipid A core. We have shown an association between the Wzz proteins and O-antigen polymer chains using immunoprecipitation with anti-O5 O-antigen monoclonal antibody MF15-4. Both Wzz1 and Wzz2 could be co-precipitated with O5 polymer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».