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Enregistrement W2086925239 · doi:10.1021/pr0502626

Insulin-dependent Interactions of Proteins with GLUT4 Revealed through Stable Isotope Labeling by Amino Acids in Cell Culture (SILAC)*

2005· article· en· W2086925239 sur OpenAlex
Leonard J. Foster, Assaf Rudich, Ilana Talior, Nish Patel, Xudong Huang, L. Michelle Furtado, Philip J. Bilan, Matthias Mann, Amira Klip

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStable isotope labeling by amino acids in cell cultureChemistryGLUT4Isotopic labelingBiochemistryAmino acidQuantitative proteomicsInsulinStable isotope ratioCell cultureProteomicsCell biologyComputational biologyBiologyGeneticsEndocrinologyGeneOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The insulin-regulated glucose transporter (GLUT4) translocates to the plasma membrane in response to insulin in order to facilitate the postprandial uptake of glucose into fat and muscle cells. While early insulin receptor signaling steps leading to this translocation are well defined, the integration of signaling and regulation of GLUT4 traffic remains elusive. Several lines of evidence suggest an important role for the actin cytoskeleton and for protein-protein interactions in regulating GLUT4 localization by insulin. Here, we applied stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC) to identify proteins that interact with GLUT4 in an insulin-regulated manner. Myc-tagged GLUT4 (GLUT4myc) stably expressed in L6 myotubes was immunoprecipitated via the myc epitope from total membranes isolated from basal and insulin-stimulated cells grown in medium containing normal isotopic abundance leucine or deuterated leucine, respectively. Proteins coprecipitating with GLUT4myc were analyzed by liquid chromatography/ tandem mass spectrometry. Of 603 proteins quantified, 36 displayed an insulin-dependent change of their interaction with GLUT4myc of more than 1.5-fold in either direction. Several cytoskeleton-related proteins were elevated in immunoprecipates from insulin-treated cells, whereas components of the ubiquitin-proteasome degradation system were generally reduced. Proteins participating in vesicle traffic also displayed insulin-regulated association. Of cytoskeleton-related proteins, alpha-actinin-4 recovery in GLUT4 immunoprecipitates rose in response to insulin 2.1 +/- 0.5-fold by SILAC and 2.9 +/- 0.8-fold by immunoblotting. Insulin caused GLUT4 and alpha-actinin-4 co-localization as revealed by confocal immunofluorescence microscopy. We conclude that insulin elicits changes in interactions between diverse proteins and GLUT4, and that cytoskeletal proteins, notably alpha-actinin-4, associate with the transporter, potentially to facilitate its routing to the plasma membrane.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,186
Score d'incertitude au seuil0,445

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle