Biochemical, Structural, and Genetic Characterization of Tridecaptin A<sub>1</sub>, an Antagonist of <i>Campylobacter jejuni</i>
Notice bibliographique
Résumé
Bacillus circulans NRRL B-30644 (now Paenibacillus terrae) was previously reported to produce SRCAM 1580, a bacteriocin active against the food pathogen Campylobacter jejuni. We have been unable to isolate SRCAM 1580, and did not find any genetic determinants in the genome of this strain. We now report the reassignment of this activity to the lipopeptide tridecaptin A₁. Structural characterization of tridecaptin A1 was achieved through NMR, MS/MS and GC-MS studies. The structure was confirmed through the first chemical synthesis of tridecaptin A₁, which also revealed the stereochemistry of the lipid chain. The impact of this stereochemistry on antimicrobial activity was examined. The biosynthetic machinery responsible for tridecaptin production was identified through bioinformatic analyses. P. terrae NRRL B-30644 also produces paenicidin B, a novel lantibiotic active against Gram-positive bacteria. MS/MS analyses indicate that this lantibiotic is structurally similar to paenicidin A.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».