Expressed sequence tag analysis of the emu (Dromaius novaehollandiae) pituitary by 454 GS Junior pyrosequencing
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Emus (Dromaius novaehollandiae) are farmed for their oil for pharmaceutical and cosmetic uses. This emu pituitary expressed sequence tag study was undertaken to identify novel transcripts in the emu pituitary to propel their identification and functional studies. By mapping reads derived from the Roche 454 GS Junior pyrosequencer to 8 reference species (human, mouse, chicken, zebra finch, fruit fly, turkey, round worm, and Carolina anole lizard) from the UniGene database, a total of 81,788 reads (53,312 mapped reads) were obtained and assembled with Reference Sequence (RefSeq). We annotated 6,676 potential emu genes by referencing 7 species (excluding lizard) and identified 1,232 potential genes common among 3 species (human, mouse, and chicken) with complete available reference genomes. Gene Ontology analysis revealed 376 Gene Ontology terms showing, with the highest counts, their involvements in biological processes, metabolism, and cellular components. These potential genes were detected to associate with 20 pathways including mitogen-activated protein kinase, insulin, neurotrophin signaling pathways, and carbohydrate digestion and absorption pathway. We also revealed a panel of tissue-specific genes including regulator of G-protein signaling protein (RGS), glucagon-like peptide receptor (GLPR), and growth hormone-inducible transmembrane protein (GHITM). Additionally, fatty acid binding protein (FABP), fatty acid desaturase (FAS), and stearoyl-coenzyme A desaturase (SCD), key enzyme genes in fat metabolism, were found to be also expressed in emu pituitary. This expressed sequence tag study represents the first step in functional characterization of emu pituitary gene expression and SNP identification for the improvement of fat production in the emu.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle