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Enregistrement W2087059905 · doi:10.1111/j.1529-8817.2006.00161.x

MOLECULAR PHYLOGENY OF SELECTED MEMBERS OF THE ORDER THALASSIOSIRALES (BACILLARIOPHYTA) AND EVOLUTION OF THE FULTOPORTULA<sup>1</sup>

2006· article· en· W2087059905 sur OpenAlexaff
Irena Kaczmarska, Margaret J. Beaton, Anita C. Benoit, Linda Medlin

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensMount Allison University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeParaphylyGenusCladeSister groupContext (archaeology)DiatomEvolutionary biologyMolecular phylogeneticsZoologyTaxonBotanyPaleontologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent phylogenetic studies of the diatoms indicate that members of the order Thalassiosirales occupy an interesting position in the diatom evolutionary tree. Despite their radial morphology and scaly auxospores, they are consistently recovered in molecular analyses as a member of subdivision Bacillariophytina and a sister clade to non‐fultoportulate and non‐radial lithodesmioids. This study included 46 species from nine traditionally accepted extant genera, and analyzed 43 nuclear small subunit (SSU) rRNA sequences in parallel with a survey of the variation in fultoportula structure. Three possible scenarios leading to the evolution of the fultoportula are discussed in the context of molecular and morphological similarities between the examined Thalassiosirales and their SSU rRNA sister clade Lithodesmiales. We speculate that the fultoportula might be derived by a modification of either a cribrum in an areola (fultoportula within an areola), or structures similar to marginal ridges now seen in lithodesmioids around a cluster of poroids (fultoportula in a tube), or finally, that the central fultoportula may have an origin different from the marginal fultoportulae. Our data confirm that fultoportula‐bearing diatoms constitute a natural phylogenetic group. The families Thalassiosiraceae, Skeletonemaceae, and Stephanodiscaceae and the genus Thalassiosira Cleve were unexpectedly found to be paraphyletic. Further, Cyclotella Kutz. and Stephanodiscus Ehr. may not be closely related and some species of these genera are more closely allied to other species of Thalassiosira . The generitype, T. nordenskioeldii , is embedded within a large poorly structured cluster of species that includes several members of Thalassiosira , Planktoniella sol , Minidiscus trioculatus , and two members of Stephanodiscus . An emendment of the order Lithodesmiales and the family Lauderiaceae are proposed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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