Structural and Thermodynamical Characterization of the Complete p21 Gene Product of Max
Notice bibliographique
Résumé
The b-HLH-LZ family of transcription factors contains numerous proteins including the Myc and Mad families of proteins. Max heterodimerizes with other members to bind the E-Box DNA sequence in target gene promoters. Max is the only protein in this network that recognizes and binds E-Box DNA sequences as a homodimer in vitro and represses transcription of Myc target genes in vivo. Key information such as the structure of p21 Max, the complete gene product, and its KD in the absence of DNA are still unknown. Here, we report the characterization of the secondary and quaternary structures, the dimerization and DNA binding of p21 Max and a thermodynamically stable mutant. The helical content of p21 Max indicates that its N-terminal and C-terminal regions are unstructured in the absence of DNA. NMR experiments further support the location of folded and unfolded domains. We also show that p21 Max has an apparent KD (37 degrees C) of 7 x 10(-6), a value 10-100 times smaller than the b-HLH-LZ itself. We demonstrate that electrostatic repulsions are responsible for the higher KD of the b-HLH-LZ. Finally, we show that a p21 Max double mutant forms a very stable dimer with a KD (37 degrees C) of 3 x 10(-10) and that the protein/DNA complex depicts a higher temperature of denaturation than p21 Max/DNA complex. Our results indicate that Max could homodimerize, bind DNA, and repress transcription in vivo and that its mutant could be more efficient at repressing the expression of c-Myc target genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».