MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2087253029 · doi:10.1097/fpc.0b013e3282f4711d

Genetic analysis of a relationship between macrocyclic lactone and benzimidazole anthelmintic selection on Haemonchus contortus

2008· article· en· W2087253029 sur OpenAlexaff
M Mottier, Roger K. Prichard

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueHelminth infection and control
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHaemonchus contortusBiologyAnthelminticIsotypeSingle-nucleotide polymorphismGeneticsMolecular biologyGeneNematodeGenotypeAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: We have found that in a laboratory strain of the nematode parasite of ruminants, Haemonchus contortus, repeated ivermectin treatment, in vivo in sheep, selected against TTC, coding for Phe, and for TAC, coding for Tyr, at codon 200 in beta-tubulin isotype 1. This 200Tyr single nucleotide polymorphism (SNP) has been associated with benzimidazole anthelmintic resistance. In this study, we investigated the alpha-tubulin and beta-tubulin sequences of 17 different field and laboratory strains/isolates of H. contortus with known treatment history and status for susceptibility or resistance to macrocyclic lactone (ML) or benzimidazole anthelmintics. BASIC METHODS: DNA (genomic or cDNA) from 10 to 32 male parasites was sequenced for alpha-tubulin or beta-tubulin for each strain/isolate and the frequency of coding SNPs was compared between the different strains/isolates with known treatment history and drug resistance status. MAIN RESULTS: We have analyzed alpha-tubulin and beta-tubulin isotypes 1 and 2 genes from the different H. contortus strains/isolates and found that repeated ivermectin or moxidectin (both ML anthelmintics) use changes the frequency of beta-tubulin isotype 1 alleles and selects for the following SNPs: either from TTC (Phe) to TAC (Tyr) at codon 200 or codon 167, or from GCA (Ala) to GAA (Glu) at codon 198. 200Tyr and 167Tyr were associated with GTT (Val) or CTC/CTT (Leu) at codon 368, whereas 200Phe or 167Phe were associated with either ATT (Ile) or GTT (Val) at codon 368 in beta-tubulin isotype 1. The SNPs 200Tyr, 167Tyr in beta-tubulin isotype 1 have been described to confer benzimidazole resistance in nematodes and recently 198Ala has also been associated with benzimidazole resistance. CONCLUSIONS: Although MLs exert their antiparasitic effect through binding to ligand-gated chloride channels, benzimidazoles interact with beta-tubulin. These genetic analyses indicate that there is a correlation between exposure and/or resistance to MLs and an increase in the frequency of the beta-tubulin alleles containing codons, which are determinant for benzimidazole resistance. ML use may predispose parasitic nematodes to benzimidazole resistance. This has major implications for parasite control programs dependent on MLs/benzimidazole rotations and on the use of ML/benzimidazole combination therapy, such as for human lymphatic filariasis and nematode control in ruminant livestock.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations143
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePharmacogenetics and GenomicsMême sujetHelminth infection and controlTravaux en français237 207