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Enregistrement W2087260415 · doi:10.1074/jbc.m311887200

Changes in the Expression of Many Ets Family Transcription Factors and of Potential Target Genes in Normal Mammary Tissue and Tumors

2004· article· en· W2087260415 sur OpenAlexaff
Christina K. Galang, William J. Muller, Gabriele Foos, Robert G. Oshima, Craig A. Hauser

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésETS transcription factor familyBiologyTranscription factorMammary tumorGene expressionGeneCancer researchGeneticsCancerBreast cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interfering with Ets transcription factor function reverses multiple aspects of the transformed phenotype of mouse or human tumor cells. However, the unknown number of individual Ets factors expressed in any cellular context and the similar DNA binding specificities of Ets family members complicates the identification of those that mediate transformation. By utilizing quantitative PCR assays for 25 mouse Ets factors, we analyzed the expression of essentially the entire Ets family in normal mammary tissue, mammary-related cell lines, and mammary tumors. In normal mammary tissue, 24 Ets factors were expressed. Even clonal derived cell lines expressed 14-20 Ets members. The most abundant Ets factor mRNAs measured in normal mammary tissue were Elk4, Elf1, and Ets2. Subtractive analysis of mammary tissue identified which Ets factors were predominantly expressed in the myeloid/lymphoid or epithelial cell compartments. Comparison of Ets factor expression in normal mammary tissue and mammary tumors identified significantly elevated expression of Pse/PDEF, Ese2/Elf5, Ese3/Ehf, TEL/Etv6, and Elf2/NERF in mammary tumors and confirmed previously reported alterations in expression of Ese1/Elf3 and the PEA3 subfamily. Expression of 13 Ets target genes, implicated in various aspects of tumor progression, was also analyzed. Altered expression of particular Ets target genes was significantly correlated with particular Ets factors (e.g. maspin and Ese2), suggesting specific in vivo regulatory roles. Together, this comprehensive analysis revealed unexpectedly diverse Ets family gene expression, characterized novel Ets factor changes in mammary tumors, and implicated specific Ets factors in the regulation of multiple genes involved in mammary tumor progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,229

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations130
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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