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Enregistrement W2087278037 · doi:10.1007/s12031-012-9871-9

Genetic Analysis of Disheveled 2 and Disheveled 3 in Human Neural Tube Defects

2012· article· en· W2087278037 sur OpenAlexafffund
Patrizia De Marco, Elisa Merello, Alessandro Consales, Gianluca Piatelli, Armando Cama, Zoha Kibar, Valeria Capra

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Neuroscience · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueKruppel-like factors research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesSick Kids Foundation
Mots-clésNeural tubeBiologyGeneticsMissense mutationWnt signaling pathwayFrizzledCell biologyGeneMutationEmbryo

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neural tube defects are severe malformations affecting 1/1,000 live births. The planar cell polarity pathway controls the neural tube closure and has been implicated in the pathogenesis of neural tube defects both in animal models and human cohorts. In mouse disruption of Dvl2 alone (Dvl2 (-/-)) or Dvl2 and Dvl3 (Dvl2 (-/-); Dvl3 (+/-), Dvl2 (+/-); Dvl3 (-/-)) results in incomplete neurulation, suggesting a role for Disheveled in neural tube closure. Disheveled is a multifunctional protein that is involved in both the canonical Wnt signaling and the noncanonical planar cell polarity pathway. In this study, we analyzed the role of the human orthologs DVL2 and DVL3 in a cohort of 473 patients with neural tube defects. Rare variants were genotyped in 639 ethnically matched controls. We identified seven rare missense mutations that were absent in all controls analyzed. Two of these mutations, p.Tyr667Cys and p.Ala53Val, identified in DVL2 were predicted to be detrimental in silico. Significantly, a 1-bp insertion (c.1801_1802insG) in exon 15 of DVL2 predicted to lead to the truncation of the protein was identified in a patient with a complex form of caudal agenesis. In summary, we demonstrate a possible role for rare variants in DVL2 gene as risk factors for neural tube defects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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