Genetic Analysis of Disheveled 2 and Disheveled 3 in Human Neural Tube Defects
Notice bibliographique
Résumé
Neural tube defects are severe malformations affecting 1/1,000 live births. The planar cell polarity pathway controls the neural tube closure and has been implicated in the pathogenesis of neural tube defects both in animal models and human cohorts. In mouse disruption of Dvl2 alone (Dvl2 (-/-)) or Dvl2 and Dvl3 (Dvl2 (-/-); Dvl3 (+/-), Dvl2 (+/-); Dvl3 (-/-)) results in incomplete neurulation, suggesting a role for Disheveled in neural tube closure. Disheveled is a multifunctional protein that is involved in both the canonical Wnt signaling and the noncanonical planar cell polarity pathway. In this study, we analyzed the role of the human orthologs DVL2 and DVL3 in a cohort of 473 patients with neural tube defects. Rare variants were genotyped in 639 ethnically matched controls. We identified seven rare missense mutations that were absent in all controls analyzed. Two of these mutations, p.Tyr667Cys and p.Ala53Val, identified in DVL2 were predicted to be detrimental in silico. Significantly, a 1-bp insertion (c.1801_1802insG) in exon 15 of DVL2 predicted to lead to the truncation of the protein was identified in a patient with a complex form of caudal agenesis. In summary, we demonstrate a possible role for rare variants in DVL2 gene as risk factors for neural tube defects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».