Differential Repression by Freud-1/CC2D1A at a Polymorphic Site in the Dopamine-D2 Receptor Gene
Notice bibliographique
Résumé
Freud-1/CC2D1A is a transcriptional repressor of the serotonin-1A receptor gene and was recently genetically linked to non-syndromic mental retardation. To identify new Freud-1 gene targets, data base mining for Freud-1 recognition sequences was done. A highly homologous intronic element (D2-DRE) was identified in the human dopamine-D2 receptor (DRD2) gene, and the role of Freud-1 in regulating the gene at this site was assessed. Recombinant Freud-1 bound specifically to the D2-DRE, and a major protein-D2-DRE complex was identified in nuclear extracts that was supershifted using Freud-1-specific antibodies. Endogenous Freud-1 binding to the D2-DRE in cells was detected using chromatin immunoprecipitation. The D2-DRE conferred strong repressor activity in transcriptional reporter assays that was dependent on the Freud-1 recognition sequence. In three different human cell lines, the level of Freud-1 protein was inversely related to DRD2 expression. Knockdown of endogenous Freud-1 using small interfering RNA resulted in an up-regulation of DRD2 RNA and binding sites, demonstrating a crucial role for Freud-1 in DRD2 regulation. A previously uncharacterized single nucleotide A/G polymorphism (rs2734836) was located adjacent to the D2-DRE and conferred allele-specific Freud-1 binding and repression, with the major G-allele having reduced activity. These studies demonstrate a key role for Freud-1 to regulate DRD2 expression and provide the first mechanistic insights into its transcriptional regulation. Allele-specific regulation of DRD2 expression by Freud-1 may possibly associate with psychiatric disorders or mental retardation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».