MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2087675111 · doi:10.1093/neuonc/nov061.138

PM-16 * AN ANIMAL MODEL OF 17p DELETION IN MEDULLOBLASTOMA

2015· article· en· W2087675111 sur OpenAlexaff
J.H. Peacock, Aniruddha Bagchi, Sarah J. Egan, Michael D. Taylor

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromosome 17 (human)BiologyGene duplicationGeneticsChromosome 22Chromosome 21Chromosome 12IsochromosomeChromosomeMolecular biologyGeneKaryotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Medulloblastoma is the most frequent malignant pediatric brain tumor with an incidence of 0.5-0.8/100,000 children. Up to 40% of tumors have chromosome 17p deletions and 17q duplications, usually in the context of isochromosome 17q (i17q). The high frequency of i17q in medulloblastoma is hypothesized to be secondary to a role in tumor initiation and progression. To test this hypothesis we have chromosome engineered ‘17p’ deletions and ‘17q’duplications in the syntenic region of mouse chromosome 11 to evaluate the role of chromosome 17 aberrations in medulloblastoma. METHOD: The Mutagenic Insertion and Chromosome Engineering Resource (MICER) was used to chromosome engineer ‘17p’ deletions and ‘17q’ duplications. loxP sites were sequentially targeted to sites flanking the syntenic 17p or 17q region of mouse chromosome 11. Cre-recombinase deleted or duplicated the chromosome 17 target regions in mouse ES cells and recombinant clones were isolated with HAT selection. Florescent In-situ Hybridization confirmed the 18 megabase deletion of ‘17p’ and the 45 megabase duplication of 17q from mouse ES cells. Mice with Cre inducible floxed (Cis) alleles or constitutive deletion/duplication (Trans) alleles were generated. RESULTS: Chimeric founder mice with constitutive deletion/duplication (Trans) alleles were generated from mouse ES cells for both‘17p’ and ‘17q’. Offspring inherited either the desired ‘17p’ deletion allele or a ‘17p’ duplication allele. However, experimentally only ‘17p’ duplication pups were born, indicating the constitutive ‘17p’ deletion and ‘17q’ deletion/duplication alleles are likely embryonic lethal. Conditional 17p-Cis deletion mice have been bred to Nestin-cre/Ptc + /−, these mice develop medulloblastoma harboring the 18 Mbp chromosome ‘17p’ equivalent deletion in 15% of tumours. CONCLUSION: Herein we have generated a sporadic and faithful murine model of the most common cytogenetic aberration present in human medulloblastoma. This model will serve as an invaluable tool for further biological discovery and therapeutic modeling of most cases of high risk medulloblastoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeuro-OncologyMême sujetGlioma Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207