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Enregistrement W2087794640 · doi:10.1074/jbc.m300861200

The Schizosaccharomyces pombe Cuf1 Is Composed of Functional Modules from Two Distinct Classes of Copper Metalloregulatory Transcription Factors

2003· article· en· W2087794640 sur OpenAlexafffund
Jude Beaudoin, Alexandre Mercier, Réjean Langlois, Simon Labbé

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSchizosaccharomyces pombeSaccharomyces cerevisiaeYeastTranscription factorGeneBiologyFusion proteinMutantSchizosaccharomycesAmino acidCopperTransporterTranscription (linguistics)BiochemistryGeneticsChemistryRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In fission yeast, the genes encoding proteins that are components of the copper transporter family are controlled at the transcriptional level by the Cuf1 transcription factor. Under low copper availability, Cuf1 induces expression of the copper transporter genes. In contrast, sufficient levels of copper inactivate Cuf1 and expression of its target genes. Our study reveals that Cuf1 harbors a putative copper-binding motif, Cys-X-Cys-X(3)-Cys-X-Cys-X(2)-Cys-X(2)-His, within its carboxyl-terminal region to sense changing environmental copper levels. Binding studies reveal that the amino-terminal 174-residue segment of Cuf1 expressed as a fusion protein in Escherichia coli specifically interacts with the cis-acting copper transporter promoter element CuSE (copper-signaling element). Within this region, the first 61 amino acids of Cuf1 exhibit more overall homology to the Saccharomyces cerevisiae Ace1 copper-detoxifying factor (from residues 1 to 63) than to Mac1, its functional ortholog. Consistently, we demonstrate that a chimeric Cuf1 protein bearing the amino-terminal 63-residue segment of Ace1 complements cuf1 Delta null phenotypes. Furthermore, we show that Schizosaccharomyces pombe cuf1Delta mutant cells expressing the full-length S. cerevisiae Ace1 protein are hypersensitive to copper ions, with a concomitant up-regulation of CuSE-mediated gene expression in fission yeast. Taken together, these studies reveal that S. cerevisiae Ace1 1-63 is functionally exchangeable with S. pombe Cuf1 1-61, and the nature of the amino acids located downstream of this amino-terminal conserved region may be crucial in dictating the type of regulatory response required to establish and maintain copper homeostasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,435

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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