MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2087796131 · doi:10.1136/jcp.2008.061622

Correlation between molecular and histopathological diagnoses of B cell lymphomas in bone marrow biopsy and aspirates

2009· article· en· W2087796131 sur OpenAlexaff
Raquel Ilgenfritz, Kanita Kayasut, A. Le Tourneau, Ors'Anton Calendini, Lamia Ouafi, Christophe Marzac, J Diébold, Francis Devez, Véronique Ducruit, Pierre-Étienne Bouchet, Josée Audouin, Thierry Jo Molina

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHematological disorders and diagnostics
Établissements canadiensHotel Dieu Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBone marrowPathologyBiopsyMedicineMedical diagnosisLymphoma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: PCR has been shown previously to be the most sensitive technique to detect a clonal population in marrow aspirates (MAs), and the clinical standard for evaluation of bone marrow lymphoma involvement today is bone marrow trephine biopsy (BMTB). The goal of this study was to compare morphological evaluation of B cell neoplasm in BMTB (histology and immunohistochemistry) and PCR analysis in MA, with both specimens obtained at the same time, in patients with a known molecular marker of the disease. METHODS: This was a retrospective evaluation of 98 consecutive BMTB specimens from 60 patients with a known B-cell neoplasm and a previous PCR marker of the disease (BCL2 and/or IGH). RESULTS: Considering the IGH PCR cases alone, a B cell clone was detected in 85% and 39% of the morphology (M) positive and negative groups, respectively. Five M(+), IGH(-) cases were found, including two cases of follicular lymphoma (FL), one case of diffuse large B cell lymphoma, and two cases of mantle cell lymphoma. The FLs had about 20% and 50% of BMTB involvement each. All other cases had minimal lymphoma localisation. The two FLs were also BCL2-MBR(+). Use of BCL2-MBR detected all M(+) cases and 66% of M(-) cases whenever it was an initial marker of disease. CONCLUSIONS: IGH PCR alone is not good enough for BMTB assessment, especially in FL. On the other hand, the PCR study for BCL2 is more sensitive than morphology, without any false negative results in this series, suggesting that BCL2-MBR PCR on MA can be used as an alternative and more sensitive examination for disease evaluation, providing that there is careful analysis of data, adequate knowledge of PCR pitfalls and absence of other haematological disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical PathologyMême sujetHematological disorders and diagnosticsTravaux en français237 207