Analysis of BAC clones containing homologous sequences on the end of the Xq arm and on chromosome 7 in the dioecious plant<i>Silene latifolia</i>
Notice bibliographique
Résumé
Silene latifolia is a model dioecious plant with morphologically distinguishable XY sex chromosomes. The end of the Xq arm is quite different from that of the Yp arm, although both are located at opposite ends of their respective chromosomes relative to a pseudo-autosomal region. The Xq arm does not seem to originate from the same autosome as the Yp arm. Bacterial artificial chromosome clone #15B12 has an insert containing a 130-kb stretch in which a 313-bp satellite DNA is repeated 420 times. PCR with a single primer revealed that this 130-kb stretch consists of three reversals of the orientation of the satellite DNA. A non-long terminal repeat retroelement and two sequences that share homology with an Oryza sativa RING zinc finger and a putative Arabidopsis thaliana protein, respectively, were found in the sequences that flank the satellite DNA. Fluorescence in situ hybridization carried out using this low-copy region of #15B12 as a probe confirmed that these sequences originated from the X chromosome and that homologous sequences exist at the end of chromosome 7. The region distal to DD44X on the Xq arm is postulated to have recombined with a region containing satellite DNA on chromosome 7 during the process of sex chromosome evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».