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Enregistrement W2088019779 · doi:10.1021/bi5008707

Besides Fibrillization: Putative Role of the Peptide Fragment 71–82 on the Structural and Assembly Behavior of α-Synuclein

2014· article· en· W2088019779 sur OpenAlexafffund
Laurie Bédard, Thierry Lefèvre, Émilie Morin-Michaud, Michéle Auger

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversité LavalPROTEO
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPeptideChemistryFibrilMembraneBiophysicsMonomerVesiclePhospholipidPeptide sequenceSequence (biology)Intermolecular forceMolecular dynamicsLipid bilayerCrystallographyAmino acidProtein secondary structureBiochemistryMoleculeOrganic chemistryBiologyComputational chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fibrillization of α-synuclein (α-syn) is involved in Parkinson's disease, a neurodegenerative disorder that affects four million people in the world. The amino acid sequence 71-82 of this protein (VTGVTAVAQKTV) has appeared to be essential for fibril formation. In the present study, we have investigated the secondary structure and thermal stability of the peptide fragment 71-82, α-syn71-82, as a function of concentration and temperature, as well as its interactions with phospholipid model membranes using various spectroscopic techniques. The data show that α-syn71-82 is mainly disordered in solution with the presence of a few β-sheet structure elements. The peptide reversibly forms intermolecular β-sheets with increasing concentration and decreasing temperature, suggesting that it is subjected to a thermodynamic equilibrium between a monomeric and an oligomeric form. This equilibrium seems to be affected by the presence of zwitterionic membranes. Conversely, the influence of the peptide on zwitterionic lipid bilayers is small and concentration-dependent. By contrast, α-syn71-82 is strongly affected by anionic vesicles. The peptide indeed exhibits a dramatic conformational change, reflecting an extensive and irreversible self-aggregation, the majority of the amino acids being involved in a parallel β-sheet conformation. The aggregates appear to be located near the membrane surface but do not perturb significantly the membrane order. Comparing these results with the literature, it appears that α-syn71-82 shares several general properties and structural similarities with its parent protein. These common points suggest that the sequence 71-82 may overall contribute to the behavior and properties of α-syn.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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