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Enregistrement W2088035066 · doi:10.1111/j.1349-7006.2009.01128.x

Translocation t(11;18)(q21;q21) in gastric B‐cell lymphomas

2009· article· en· W2088035066 sur OpenAlexaff
Sonia Toracchio, Hiroyoshi Ota, Daphne de Jong, Andrew Wotherspoon, Massimo Rugge, David Y. Graham, Amir Samani, H. M. T. EL‐ZIMAITY

Notice bibliographique

RevueCancer Science · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesOffice of Research and DevelopmentFondazione Italiana per la Ricerca sul CancroU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésLymphomaChromosomal translocationPathologyMALT lymphomaLymphatic systemMucosa-associated lymphoid tissueBiologyB cellGastric mucosaFluorescence in situ hybridizationMolecular biologyStomachMedicineImmunologyAntibodyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Translocation t(11;18)(q21;q21) is the most frequent chromosomal aberration reported in gastric mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphomas. Intriguingly, this translocation has been reported only rarely in diffuse large B-cell lymphomas; it has been proposed that t(11;18)-positive tumors rarely progress to diffuse large B-cell lymphomas. We examined the frequency of chromosomal translocation t(11;18)(q21;q21) in mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma and diffuse large B-cell lymphoma of the stomach. Paraffin-embedded tissues from patients with gastric B-cell lymphomas were selected retrospectively. The presence of the t(11;18)(q21;q21) was determined using reverse transcriptase-polymerase chain reaction and/or fluorescence in situ hybridization. beta-Actin transcript was also determined to evaluate the integrity and efficiency of RNA (cDNA) recovery from paraffin-embedded tissues. We analyzed 53 gastric B-cell lymphomas (33 diffuse large B-cell and 20 mucosa-associated lymphoid tissue) obtained from Italy, the USA, or Japan. Beta-actin transcript was amplified in 50 cases (94%), including 19 mucosa-associated lymphoid tissue and 31 diffuse large B-cell lymphomas (five with mucosa-associated lymphoid tissue components). The t(11;18) translocation was detected in 19% (6 of 31) cases with diffuse large B-cell lymphoma versus 26% (five of 19) with mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma (P = 0.72). One of five diffuse large B-cell lymphomas with a mucosa-associated lymphoid tissue component showed the t(11;18)(q21;q21). In conclusion, translocation t(11;18)(q21;q21) was found in both mucosa-associated lymphoid tissue lymphomas and diffuse large B-cell lymphomas of the stomach at approximately equivalent frequencies; its presence does not exclude progression to diffuse large B-cell lymphoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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