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Enregistrement W2088043148 · doi:10.1139/w01-116

The operon for cytokinin biosynthesis of <i>Erwinia herbicola</i> pv. <i>gypsophilae</i> contains two promoters and is plant induced

2001· article· en· W2088043148 sur OpenAlexvenueno aff
Ming Guo, Shulamit Manulis, Isaac Barash, Amnon Lichter

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDeutsche ForschungsgemeinschaftUnited States - Israel Binational Agricultural Research and Development Fund
Mots-clésBiologyOperonErwiniaMutantGene clusterTransposable elementMicrobiologyPlasmidGenePromoterMolecular biologyGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The operon for cytokinin biosynthesis in the gall-forming bacterium Erwinia herbicola pv. gypsophilae (Ehg) has been previously shown to reside on an indigenous plasmid (pPATH(Ehg)) that is mandatory for pathogenicity. This operon consists of two genes: the first open reading frame (pre-etz) is of unknown function, whereas the second one (etz) encodes for isopentenyl transferase. Northern hybridization performed with the wild-type strain Ehg824-1 grown in Luria-Bertani broth demonstrated two transcripts of which an etz-specific transcript (1.0 kb) was predominant. Fusion of upstream DNA fragments of both pre-etz and etz to the ice nucleation reporter gene inaZ in pVSP61 showed high ice nucleation activity in both cultures, confirming the presence of two independent promoters. An increase of 1-1.5 orders in transcriptional activity of these promoters was observed following inoculation of gypsophila cuttings. Mutants of Ehg824-1 were generated by insertion of inaZ into pre-etz and etz using the transposon reporter Tn3-Spice. An increase of about two orders in transcriptional activity was recorded with both mutants following inoculation of gypsophila or bean cuttings. A similar induction was also observed when the bacteria were applied to the leaf surface of these plants. Unlike other virulence genes present on the pPATH(Ehg), neither pre-etz nor etz was regulated by the adjacent hrp gene cluster.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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