Prevalence of the K65R resistance reverse transcriptase mutation in different HIV‐1 subtypes in Israel
Notice bibliographique
Résumé
The K65R mutation in HIV-1 reverse transcriptase (RT) can be selected by the RT inhibitors tenofovir (TDF), abacavir (ABC), and didanosine (DDI). Recently, in vitro studies have shown that K65R is selected in tissue culture more rapidly with subtype C than subtype B viruses. The prevalence of K65R in viruses sequenced at the Tel-Aviv AIDS Center was evaluated. This study analyzed retrospectively sequences from 1999 to 2007 in patients treated with TDF, ABC, and/or DDI and compared rates of mutational prevalence between subtypes. Fisher's exact test was used to determine statistical significance. Forty-four sequences from patients treated with the three above-cited drugs were analyzed. Subtypes A (n = 1), CRF01_AE (n = 4), CRF02_AG (n = 2), B (n = 21), C (n = 11), D (n = 1), F (n = 3), and G (n = 1) were represented. Seven non-B viruses had the K65R mutation, which was only found in one subtype B virus. Of these seven samples four were subtype C, one was subtype CRF01_AE, and two were subtype CRF02_AG. None of the eight viruses with K65R harbored thymidine analogue mutations. In this study, non-subtype B viruses possessed the K65R mutation at higher incidence than subtype B viruses. Subtype C viruses may be especially prone to develop this mutation. Larger studies are needed to confirm these data. Efforts should be intensified to understand better differences in drug resistance between various HIV subtypes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».