MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2088136743 · doi:10.1074/jbc.m109.022632

Nuclear Receptor Co-repressor Is Required to Maintain Proliferation of Normal Intestinal Epithelial Cells in Culture and Down-modulates the Expression of Pigment Epithelium-derived Factor

2009· article· en· W2088136743 sur OpenAlexafffund
Geneviève Doyon, Stéphanie St‐Jean, Mathieu Darsigny, Claude Asselin, François Boudreau

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésRepressorCell biologyEpitheliumIntestinal epitheliumBiologyReceptorPigmentChemistryGene expressionBiochemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stem cells of the gut epithelium constantly produce precursors that progressively undergo a succession of molecular changes resulting in growth arrest and commitment to a specific differentiation program. Few transcriptional repressors have been identified that maintain the normal intestinal epithelial cell (IEC) proliferation state. Herein, we show that the nuclear receptor co-repressor (NCoR1) is differentially expressed during the proliferation-to-differentiation IEC transition. Silencing of NCoR1 expression in proliferating cells of crypt origin resulted in a rapid growth arrest without associated cell death. A genechip profiling analysis identified several candidate genes to be up-regulated in NCoR1-deficient IEC. Pigment epithelium-derived factor (PEDF, also known as serpinf1), a suspected tumor suppressor gene that plays a key role in the inhibition of epithelial tissue growth, was significantly up-regulated in these cells. Chromatin immunoprecipitation experiments showed that the PEDF gene promoter was occupied by NCoR1 in proliferating epithelial cells. Multiple retinoid X receptor (RXR) heterodimers interacting sites of the PEDF promoter were confirmed to interact with RXR and retinoid acid receptor (RAR). Cotransfection assays showed that RXR and RAR were able to transactivate the PEDF promoter and that NCoR1 was repressing this effect. Finally, forced expression of PEDF in IEC resulted in a slower rate of proliferation. These observations suggest that NCoR1 expression is required to maintain IEC in a proliferative state and identify PEDF as a novel transcriptional target for NCoR1 repressive action.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetDigestive system and related healthTravaux en français237 207