A Novel C2H2 Transcription Factor that Regulates gliA Expression Interdependently with GliZ in Aspergillus fumigatus
Notice bibliographique
Résumé
Secondary metabolites are produced by numerous organisms and can either be beneficial, benign, or harmful to humans. Genes involved in the synthesis and transport of these secondary metabolites are frequently found in gene clusters, which are often coordinately regulated, being almost exclusively dependent on transcription factors that are located within the clusters themselves. Gliotoxin, which is produced by a variety of Aspergillus species, Trichoderma species, and Penicillium species, exhibits immunosuppressive properties and has therefore been the subject of research for many laboratories. There have been a few proteins shown to regulate the gliotoxin cluster, most notably GliZ, a Zn2Cys6 binuclear finger transcription factor that lies within the cluster, and LaeA, a putative methyltransferase that globally regulates secondary metabolism clusters within numerous fungal species. Using a high-copy inducer screen in A. fumigatus, our lab has identified a novel C2H2 transcription factor, which plays an important role in regulating the gliotoxin biosynthetic cluster. This transcription factor, named GipA, induces gliotoxin production when present in extra copies. Furthermore, loss of gipA reduces gliotoxin production significantly. Through protein binding microarray and mutagenesis, we have identified a DNA binding site recognized by GipA that is in extremely close proximity to a potential GliZ DNA binding site in the 5' untranslated region of gliA, which encodes an efflux pump within the gliotoxin cluster. Not surprisingly, GliZ and GipA appear to work in an interdependent fashion to positively control gliA expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».