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Enregistrement W2088244328 · doi:10.1002/cbic.200700775

A β‐1,4‐Galactosyltransferase from <i>Helicobacter pylori</i> is an Efficient and Versatile Biocatalyst Displaying a Novel Activity for Thioglycoside Synthesis

2008· article· en· W2088244328 sur OpenAlexafffund
Darius‐Jean Namdjou, Hong‐Ming Chen, Denis Brochu, Stephen G. Withers, Warren W. Wakarchuk

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaNational Research Council CanadaSteacie Institute for Molecular Sciences
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiocatalysisGalactosyltransferaseHelicobacter pyloriGlycosylationBiologyBiochemistryNeisseria meningitidisMicrobiologyChemistryEnzymeGeneticsBacteriaCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Helicobacter pylori is a highly persistent and common pathogen in humans. It is the causative agent of chronic gastritis and its further stages. HP0826 is the beta-1,4-galactosyltransferase involved in the biosynthesis of the LPS O-chain backbone of H. pylori. Though it was first cloned nearly a decade ago, there are surprisingly limited data about the characteristics of HP0826, especially given its prominent role in H. pylori pathogenicity. We here demonstrate that HP0826 is a highly efficient and promiscuous biocatalyst. We have exploited two novel enzymatic activities for the quantitative synthesis of the thiodisaccharide Gal-beta-S-1,4-GlcNAc-pNP as well as Gal-beta-1,4-Man-pNP. We further show that Neisseria meningitidis beta-1,4-galactosyltransferases LgtB can be used as an equally efficient catalyst in the latter reaction. Thiodisaccharides have been extensively used in structural biology but can also have therapeutic uses. The Gal-beta-1,4-Man linkage is found in the Leishmania species LPG backbone disaccharide repeats and cap, which have been associated with vector binding in Leishmaniasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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