A β‐1,4‐Galactosyltransferase from <i>Helicobacter pylori</i> is an Efficient and Versatile Biocatalyst Displaying a Novel Activity for Thioglycoside Synthesis
Notice bibliographique
Résumé
Helicobacter pylori is a highly persistent and common pathogen in humans. It is the causative agent of chronic gastritis and its further stages. HP0826 is the beta-1,4-galactosyltransferase involved in the biosynthesis of the LPS O-chain backbone of H. pylori. Though it was first cloned nearly a decade ago, there are surprisingly limited data about the characteristics of HP0826, especially given its prominent role in H. pylori pathogenicity. We here demonstrate that HP0826 is a highly efficient and promiscuous biocatalyst. We have exploited two novel enzymatic activities for the quantitative synthesis of the thiodisaccharide Gal-beta-S-1,4-GlcNAc-pNP as well as Gal-beta-1,4-Man-pNP. We further show that Neisseria meningitidis beta-1,4-galactosyltransferases LgtB can be used as an equally efficient catalyst in the latter reaction. Thiodisaccharides have been extensively used in structural biology but can also have therapeutic uses. The Gal-beta-1,4-Man linkage is found in the Leishmania species LPG backbone disaccharide repeats and cap, which have been associated with vector binding in Leishmaniasis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».