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Enregistrement W2088246082 · doi:10.3767/003158508x361334

Description and DNA barcoding of three new species of <i>Leohumicola</i> from South Africa and the United States

2008· article· en· W2088246082 sur OpenAlexafffund
Hai D. T. Nguyen, Keith A. Seifert

Notice bibliographique

RevuePersoonia - Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario GenomicsOregon State UniversityOntario Genomics InstituteGenome Canada
Mots-clésDNA barcodingBiologyPhylogenetic treeMaximum parsimonyInternal transcribed spacerMitochondrial DNACytochrome c oxidase subunit ICladePhylogeneticsEvolutionary biologyNuclear geneGeneBotanyZoologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Three new species of Leohumicola (anamorphic Leotiomycetes) are described using morphological characters and phylogenetic analyses of DNA barcodes. Leohumicola levissima and L. atra were isolated from soils collected after forest fires in Crater Lake National Park, United States. Leohumicola incrustata was isolated from burned fynbos from the Cape of Good Hope Nature Reserve, South Africa. The three species exhibit characteristic Leohumicola morphology but are morphologically distinct based on conidial characters. Two DNA barcode regions, the Internal Transcribed Spacer (ITS) nuclear rDNA region and the cytochrome oxidase subunit I (Cox1) mitochondrial gene, were sequenced. Single-gene parsimony, dual-gene parsimony and dual-gene Bayesian inference phylogenetic analyses support L. levissima, L. atra, L. incrustata as distinct phylogenetic species. Both ITS and Cox1 barcodes are effective for the molecular identification of Leohumicola species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,518
Score d'incertitude au seuil0,425

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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