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Enregistrement W2088279998 · doi:10.1111/j.1471-4159.2009.06466.x

Rab3a interacting molecule (RIM) and the tethering of pre‐synaptic transmitter release site‐associated CaV2.2 calcium channels

2009· article· en· W2088279998 sur OpenAlexfundno aff
Fiona K. Wong, Elise F. Stanley

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésImmunoprecipitationSynaptic vesicleVoltage-dependent calcium channelCell biologyNeurotransmissionBiophysicsCalciumChemistryBiologySynaptosomeVesicleBiochemistryAntibodyMembraneReceptorImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biochemical and physiological evidence suggest that pre-synaptic calcium channels are attached to the transmitter release site within the active zone by a molecular tether. A recent study has proposed that 'Rab3a Interacting Molecule' (RIM) serves as the tether for CaV2.1 channels in mouse brain, based in part on biochemical co-immunoprecipitation (co-IP) using a monoclonal antibody, mRIM. We previously argued against this idea for CaV2.2 calcium channel at chick synapses based on experiments using a different anti-RIM antibody, pRIM1,2: while staining for the two proteins co-localized and co-varied at the transmitter release face, consistent with an association, they failed to co-IP from a synaptosome membrane lysate. RIM is, however, a family of proteins and we tested the possibility that the mRIM antibody used in the more recent study identifies a particular channel-tethering variant. We find that co-immunostaining with mRIM and anti-CaV2.2 antibody neither co-localized nor co-varied at the transmitter release face and the two proteins did not co-IP, arguing against a common protein complex and a key CaV2.2 scaffolding role for RIM at the active zone. The differing results might be reconciled, however, in a model where a RIM family member contributes to a protein bridge that anchors the pre-fusion secretory vesicle to the calcium channel protein complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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