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Enregistrement W2088292172 · doi:10.1002/ajmg.a.35996

The duplication 17p13.3 phenotype: Analysis of 21 families delineates developmental, behavioral and brain abnormalities, and rare variant phenotypes

2013· article· en· W2088292172 sur OpenAlexaff
Cynthia J. Curry, Jill A. Rosenfeld, Erica T. Grant, Karen W. Gripp, Carol E. Anderson, Arthur S. Aylsworth, Taha Ben Saad, Victor V. Chizhikov, Giedre Dybose, Christina Fagerberg, M. Falco, Christina Fels, Marco Fichera, Jesper Graakjær, Donatella Greco, Jennifer Hair, Elizabeth Hopkins, Marlene J. Huggins, Roger L. Ladda, Chumei Li, John B. Moeschler, Małgorzata J.M. Nowaczyk, Jillian R. Ozmore, S Reitano, Corrado Romano, Laura Roos, Rhonda E. Schnur, Susan L. Sell, Pim Suwannarat, Dea Svaneby, Marta Szybowska, Mark A. Tarnopolsky, Raymond C. Tervo, Anne Chun‐Hui Tsai, Megan Tucker, Stephanie E. Vallee, Ferrin C. Wheeler, Dina J. Zand, A. James Barkovich, Swaroop Aradhya, Lisa G. Shaffer, William B. Dobyns

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of Health
Mots-clésPhenotypeGene duplicationGeneticsBiologyNeuroscienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chromosome 17p13.3 is a gene rich region that when deleted is associated with the well-known Miller-Dieker syndrome. A recently described duplication syndrome involving this region has been associated with intellectual impairment, autism and occasional brain MRI abnormalities. We report 34 additional patients from 21 families to further delineate the clinical, neurological, behavioral, and brain imaging findings. We found a highly diverse phenotype with inter- and intrafamilial variability, especially in cognitive development. The most specific phenotype occurred in individuals with large duplications that include both the YWHAE and LIS1 genes. These patients had a relatively distinct facial phenotype and frequent structural brain abnormalities involving the corpus callosum, cerebellar vermis, and cranial base. Autism spectrum disorders were seen in a third of duplication probands, most commonly in those with duplications of YWHAE and flanking genes such as CRK. The typical neurobehavioral phenotype was usually seen in those with the larger duplications. We did not confirm the association of early overgrowth with involvement of YWHAE and CRK, or growth failure with duplications of LIS1. Older patients were often overweight. Three variant phenotypes included cleft lip/palate (CLP), split hand/foot with long bone deficiency (SHFLD), and a connective tissue phenotype resembling Marfan syndrome. The duplications in patients with clefts appear to disrupt ABR, while the SHFLD phenotype was associated with duplication of BHLHA9 as noted in two recent reports. The connective tissue phenotype did not have a convincing critical region. Our experience with this large cohort expands knowledge of this diverse duplication syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,618
Score d'incertitude au seuil0,327

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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