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Enregistrement W2088337613 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-14-0857

Pharmacogenetic Analysis of INT 0144 Trial: Association of Polymorphisms with Survival and Toxicity in Rectal Cancer Patients Treated with 5-FU and Radiation

2015· article· en· W2088337613 sur OpenAlexaff
Pierre Bohanes, Cathryn Rankin, Charles D. Blanke, Thomas Winder, Cornelia M. Ulrich, Stephen R. Smalley, Tyvin A. Rich, James A. Martensen, Al B. Benson, Robert J. Mayer, C. Cripps, Kathleen D. Danenberg, Karen W. Makar, Wu Zhang, Jacqueline Benedetti, Heinz‐Josef Lenz

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensOccupational Cancer Research Centre
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteU.S. Public Health Service
Mots-clésPharmacogeneticsToxicityMedicineColorectal cancerOncologyInternal medicineClinical trialCancerGenotypePharmacologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: We tested whether 18 polymorphisms in 16 genes (GSTP1, COX2, IL10, EGFR, EGF, FGFR4, CCDN1, VEGFR2, VEGF, CXCR2, IL8, MMP3, ICAM1, ERCC1, RAD51, and XRCC3) would predict disease-free survival (DFS), overall survival (OS), and toxicity in the INT0144 trial, which was designed to investigate different postoperative regimens of 5-fluorouracil (5-FU)-based chemoradiation (CRT) in locally advanced rectal cancers: Arm 1 consisted of bolus 5-FU followed by 5-FU protracted venous infusion (PVI) with radiotherapy; arm 2 was induction and concomitant PVI 5-FU with radiotherapy and arm 3 was induction and concomitant bolus 5-FU with radiotherapy. EXPERIMENTAL DESIGN: DNA from 746 stage II/III rectal patients enrolled in the Southwest Oncology Group (SWOG) S9304 phase III trial was analyzed. Genomic DNA was extracted from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tumor tissue. The polymorphisms were analyzed using direct DNA-sequencing or polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). RESULTS: GSTP1-Ile105Val (rs1695) was significantly associated with DFS and OS and its effect did not vary by treatment arm. The five-year DFS and OS were 53% and 58%, respectively, for G/G, 66% and 72% for G/A, and 57% and 66% for A/A patients. In arm 2, IL8-251A/A genotype (rs4073) was associated with a lower risk of toxicities (P = 0.04). The VEGFR2 H472Q Q/Q genotype (rs1870377) was associated with a higher risk of grade 3-5 proximal upper gastrointestinal tract (PUGIT) mucositis (P = 0.04) in arm 2. However, in arm 1, this genotype was associated with a lower risk of PUGIT mucositis (P = 0.004). CONCLUSION: rs1695 may be prognostic in patients with rectal cancer treated with adjuvant CRT. rs4073 and rs1870377 may exhibit different associations with toxicity, according to the 5-FU schedule.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil0,500

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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