MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2088338211 · doi:10.1371/journal.pone.0027492

Arctic Ocean Microbial Community Structure before and after the 2007 Record Sea Ice Minimum

2011· article· en· W2088338211 sur OpenAlexafffundabout
A. Comeau, William K. W. Li, Jean‐Éric Tremblay, Eddy C. Carmack, Connie Lovejoy

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaBedford Institute of OceanographyUniversité Laval
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans CanadaArcticNetNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésArcticThaumarchaeotaBiogeochemical cycleArchaeaTrophic levelSea iceEcologyBiologyOceanographyMicrobial population biologyClimate changeEnvironmental science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Increasing global temperatures are having a profound impact in the Arctic, including the dramatic loss of multiyear sea ice in 2007 that has continued to the present. The majority of life in the Arctic is microbial and the consequences of climate-mediated changes on microbial marine food webs, which are responsible for biogeochemical cycling and support higher trophic levels, are unknown. We examined microbial communities over time by using high-throughput sequencing of microbial DNA collected between 2003 and 2010 from the subsurface chlorophyll maximum (SCM) layer of the Beaufort Sea (Canadian Arctic). We found that overall this layer has freshened and concentrations of nitrate, the limiting nutrient for photosynthetic production in Arctic seas, have decreased. We compared microbial communities from before and after the record September 2007 sea ice minimum and detected significant differences in communities from all three domains of life. In particular, there were significant changes in species composition of Eukarya, with ciliates becoming more common and heterotrophic marine stramenopiles (MASTs) accounting for a smaller proportion of sequences retrieved after 2007. Within the Archaea, Marine Group I Thaumarchaeota, which earlier represented up to 60% of the Archaea sequences in this layer, have declined to <10%. Bacterial communities overall were less diverse after 2007, with a significant decrease of the Bacteroidetes. These significant shifts suggest that the microbial food webs are sensitive to physical oceanographic changes such as those occurring in the Canadian Arctic over the past decade.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,470
Score d'incertitude au seuil0,935

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations474
Publié2011
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetMicrobial Community Ecology and PhysiologyTravaux en français237 207