Characterization of ostrich (<i>Struthio camelus</i>) β‐microseminoprotein (MSP): Ideication of homologous sequences in EST databases and analysis of their evolution during speciation
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Notice bibliographique
Résumé
Beta-microseminoprotein, alternatively called prostatic secretory protein of 94 amino acids, is a hydrophilic, unglycosylated, small protein rich in conserved half-cystine residues. Originally found in human seminal plasma and prostatic fluids, its presence was later shown in numerous secretions and its homologs were described in many vertebrate species. These studies showed that this protein had rapidly evolved, but they failed to unambiguously identify its biological role. Here, we show that a protein isolated from ostrich pituitary gland is closely related to a similar one isolated from chicken serum and that the two are structurally related to the mammalian beta-microseminoprotein. The complete 90-amino acid sequence of the ostrich molecule was established through a combination of automated Edman degradation and matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometric procedures, including postsource decay (PSD) and ladder sequencing analyses. This study documents for the first time that beta-microseminoprotein is present in aves. It is also the first report of a C-terminal amidated form for a member of this protein family and the first in which the disulfide linkages are established. Database searches using the herein-described amino acid sequence allowed identification of related proteins in numerous species such as cow, African clawed frog, zebrafish, and Japanese flounder. These small proteins show a strikingly high rate of amino acid substitutions, especially across phyla boundaries. Noticeably, no beta-microseminoprotein-related gene could be found in the recently completed fruit fly genome, indicating that if such a gene exists in arthropods, it must have extensively diverged from the vertebrate ones.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle