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Enregistrement W2088522662 · doi:10.1110/ps.06501

Characterization of ostrich (<i>Struthio camelus</i>) β‐microseminoprotein (MSP): Ideication of homologous sequences in EST databases and analysis of their evolution during speciation

2001· article· en· W2088522662 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProtein Science · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal and reproductive studies
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of OttawaUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaNational Research Foundation
Mots-clésBiologyEdman degradationPeptide sequenceAmino acidSequence databaseGeneProtein sequencingGenomeBiochemistryGeneticsMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Beta-microseminoprotein, alternatively called prostatic secretory protein of 94 amino acids, is a hydrophilic, unglycosylated, small protein rich in conserved half-cystine residues. Originally found in human seminal plasma and prostatic fluids, its presence was later shown in numerous secretions and its homologs were described in many vertebrate species. These studies showed that this protein had rapidly evolved, but they failed to unambiguously identify its biological role. Here, we show that a protein isolated from ostrich pituitary gland is closely related to a similar one isolated from chicken serum and that the two are structurally related to the mammalian beta-microseminoprotein. The complete 90-amino acid sequence of the ostrich molecule was established through a combination of automated Edman degradation and matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometric procedures, including postsource decay (PSD) and ladder sequencing analyses. This study documents for the first time that beta-microseminoprotein is present in aves. It is also the first report of a C-terminal amidated form for a member of this protein family and the first in which the disulfide linkages are established. Database searches using the herein-described amino acid sequence allowed identification of related proteins in numerous species such as cow, African clawed frog, zebrafish, and Japanese flounder. These small proteins show a strikingly high rate of amino acid substitutions, especially across phyla boundaries. Noticeably, no beta-microseminoprotein-related gene could be found in the recently completed fruit fly genome, indicating that if such a gene exists in arthropods, it must have extensively diverged from the vertebrate ones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,264
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle